脑膜瘤患者血浆细胞外囊泡数据集
该数据集来自clinicaltrials.gov,纳入60例有放疗指征且计划MRI可见宏观肿瘤的脑膜瘤患者。在放疗前、中、后及每6个月临床随访时采集血样,分离并定量细胞外囊泡,与临床治疗反应或进展关联;同时基于纳米孔测序生成血浆EV-DNA甲基化谱用于脑膜瘤分类

基本信息
资源简介
脑膜瘤患者血浆细胞外囊泡数据集
该数据集聚焦脑膜瘤患者在放疗过程中的血浆细胞外囊泡动态变化,来源于clinicaltrials.gov登记的一项研究。研究计划纳入60例具有放疗指征、且在计划MRI上可见宏观肿瘤的脑膜瘤患者,在放疗开始前、放疗期间、放疗结束后以及每6个月一次的临床随访中采集血样,从中分离并定量细胞外囊泡,并将其与临床治疗反应或疾病进展进行关联分析。同时,研究还将基于纳米孔测序生成血浆EV-DNA的DNA甲基化谱,用于脑膜瘤的甲基化分类。整体目标在于刻画放疗期间及放疗后血浆细胞外囊泡的变化规律,识别可用于(早期)肿瘤进展监测的潜在生物标志物,并探索通过血浆细胞外囊泡DNA甲基化谱实现分子风险分层的可能性。
【数据集背景】
脑膜瘤是本研究关注的核心疾病。该数据集所依托的研究针对具有放疗指征且计划MRI上存在宏观肿瘤的脑膜瘤患者,关注其在放疗过程中及放疗后的血浆细胞外囊泡变化。研究试图将细胞外囊泡的定量特征与临床治疗反应或疾病进展相联系,并进一步借助血浆EV-DNA的DNA甲基化谱开展脑膜瘤分类,以期服务于分子风险分层。这一背景决定了数据集围绕脑膜瘤放疗人群的纵向血液样本展开,具有明确的临床随访导向。
【数据内容】
数据集涉及的内容包括:从患者血样中分离并定量的细胞外囊泡;与临床治疗反应或进展相对应的关联信息;以及基于纳米孔测序生成的血浆EV-DNA DNA甲基化谱,用于脑膜瘤的甲基化分类。血样采集覆盖放疗前、放疗期间、放疗结束后以及每6个月一次的临床随访等多个时间点,因此数据在时间维度上具有纵向特征。关于具体的细胞外囊泡定量指标、甲基化谱的具体形式与数据规模,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于clinicaltrials.gov登记的研究。研究对象为60例脑膜瘤患者,入组条件包括具有放疗指征以及计划MRI上可见宏观肿瘤。血液样本在放疗开始前、放疗期间、放疗结束后采集,并在临床随访阶段每6个月采集一次。细胞外囊泡从这些血样中分离并定量,随后与临床治疗反应或进展进行相关性分析;血浆EV-DNA的DNA甲基化谱则通过纳米孔测序生成。除上述来源与采集安排外,源站未提供更详细的采集机构、采样流程或样本处理信息。
【适用场景】
该数据集适用于脑膜瘤放疗相关研究场景,尤其是探索血浆细胞外囊泡作为(早期)肿瘤进展潜在生物标志物的方向。其纵向采样的设计可用于观察放疗前、中、后及随访期间细胞外囊泡的动态变化,并与临床治疗反应或进展建立关联。血浆EV-DNA甲基化谱可用于脑膜瘤的甲基化分类研究,并可能支持分子风险分层的探索。此外,该数据也可用于纳米孔测序在血浆EV-DNA甲基化分析中的应用研究。关于其他具体应用场景,源站未提供。
【使用方法】
使用该数据集时,可围绕两个层面展开:其一,利用不同时间点采集血样中分离定量的细胞外囊泡,分析其与临床治疗反应或疾病进展的关联,从而考察细胞外囊泡动态变化的潜在标志物价值;其二,利用基于纳米孔测序生成的血浆EV-DNA DNA甲基化谱,进行脑膜瘤的甲基化分类,并探索其与分子风险分层的联系。由于数据具有放疗前、中、后及每6个月随访的纵向结构,分析时宜考虑时间序列上的变化模式。关于具体的数据访问方式、文件组织格式与分析流程,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集计划纳入60例患者,样本量相对有限,且研究对象限定为具有放疗指征、计划MRI可见宏观肿瘤的脑膜瘤患者,代表性受此入组条件约束。数据依赖临床随访每6个月一次的采样安排,随访依从性与样本采集的完整性可能影响纵向分析的可靠性。关于数据质量评估、缺失情况、质控指标等,源站未提供。此外,该研究定位为探索性工作,其生物标志物结论尚需进一步验证,源站未提供相关验证信息。
【引用与许可】
该数据集来源于clinicaltrials.gov。关于具体的引用格式、许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT06104930
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件:脑膜瘤。总共将纳入60例脑膜瘤患者,这些患者具有放疗(RT)指征且在计划MRI上可见宏观肿瘤。将在放疗开始前、放疗期间和放疗后,以及每6个月的临床随访期间采集血样。将从血样中分离细胞外囊泡,进行定量分析,并与临床治疗反应或疾病进展进行相关性分析。此外,将基于纳米孔测序生成血浆EV-DNA的DNA甲基化图谱,用于基于甲基化的脑膜瘤分类。本研究将探讨脑膜瘤患者在放疗期间/后的血浆EV动态变化,目的是识别(早期)肿瘤进展的潜在生物标志物。脑膜瘤患者血浆EV的DNA甲基化图谱分析可能有助于分子风险分层,从而在未来促进脑膜瘤患者的分子引导临床管理。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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