phs000790:原发性和转移性结直肠癌的比较分析

该数据集为 dbGaP 收录的队列研究(Cohort),英文名 phs000790,主题为原发性和转移性结直肠癌的比较分析

dbgap
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基因组分类Cohort
phs000790: Comparative Analysis of Primary and Metastatic Colorectal Cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-05

资源简介

phs000790:原发性和转移性结直肠癌的比较分析

phs000790 是一个收录于 dbGaP 的队列研究数据集,英文全称为 Comparative Analysis of Primary and Metastatic Colorectal Cancer,中文可译为“原发性和转移性结直肠癌的比较分析”。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 其他,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。从主题标签来看,其核心特征为 Cohort(队列)。整体而言,该数据集围绕结直肠癌中原发性肿瘤与转移性肿瘤之间的比较分析展开,属于肿瘤学领域中与结直肠癌进展和转移机制相关的研究资源。其英文名称直接点明了研究的比较对象和疾病类型,而 dbGaP 的收录背景则表明它是一项以人群或患者队列为基础的研究数据集合。

【数据集背景】

该数据集来源于 dbGaP,即 NCBI 的基因型与表型数据库。dbGaP 通常收录与基因型-表型关联相关的研究数据,而本数据集被标注为队列研究(Cohort),说明其设计基础是围绕一组受试者进行长期或系统性的观察与数据收集。研究主题聚焦于原发性和转移性结直肠癌的比较分析,这意味着其背景与结直肠癌的转移过程、原发灶与转移灶之间的差异等研究方向密切相关。结直肠癌是全球常见的恶性肿瘤之一,其转移是导致治疗失败和预后不良的重要原因,因此针对原发性和转移性病灶的比较研究在肿瘤学中具有明确的问题导向。该数据集所属分类为肿瘤 / 其他,表明其在更细分的肿瘤数据类型中可能不属于某一特定单一组学或单一检测类型,而是以“其他”类别纳入。

【数据内容】

该数据集的具体数据内容,源站未提供。已知信息仅包括其英文名称、分类、来源站、源站描述和主题标签。从名称可以了解其研究主题为原发性和转移性结直肠癌的比较分析,但数据集中具体包含哪些类型的组学数据、临床信息、样本数量、变量字段、随访信息等内容,源站未提供。因此,无法进一步说明其数据表结构、分子检测层面、临床注释范围或数据文件格式。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,具体为 dbGaP 收录的研究。源站描述其为 dbGaP study (Cohort),主题标签为 Cohort。这表明其采集与来源的基本框架是 dbGaP 中的一项队列研究。关于具体的采集机构、招募地点、采样时间、纳入排除标准、样本采集流程、知情同意方式以及伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题和队列研究属性,该数据集可能适用于结直肠癌原发性与转移性病灶比较分析相关的研究场景,例如探索原发灶与转移灶之间的差异、研究结直肠癌转移相关特征等。然而,由于具体数据内容、变量类型和样本规模等信息源站未提供,无法进一步明确其适用的具体分析类型,如是否适用于基因组差异分析、转录组比较、临床预后建模或转移机制研究等。因此,适用场景仅能从其名称和主题标签所反映的研究方向进行概括,具体应用需结合源站提供的完整数据说明。

【使用方法】

该数据集的具体使用方法,源站未提供。通常 dbGaP 收录的数据可能需要通过 dbGaP 的授权访问流程获取,但本数据集的实际访问方式、是否需要申请、数据下载格式、配套分析工具或文档等,源站未提供。因此,无法给出具体的使用步骤或操作建议。

【质量与限制】

该数据集的质量与限制信息,源站未提供。包括样本量、数据完整性、批次效应、测序深度、临床信息准确性、随访完整性、潜在偏倚以及数据版本更新情况等,均未在已知信息中体现。因此,无法对其数据质量或使用限制进行具体评估。

【引用与许可】

该数据集的引用与许可信息,源站未提供。包括是否需要引用特定文献、许可类型、使用条款、数据共享限制以及商业使用规定等,均未在已知信息中说明。使用者应参考 ncbi.nlm.nih.gov 上 dbGaP 对应研究页面的正式说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000790

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Cohort).

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