phs000648:胰腺癌病例对照关联研究
数据以病例对照设计组织,可用于胰腺癌相关遗传关联分析,比较病例组与对照组在遗传变异上的分布差异,进而探索与胰腺癌风险相关的候选因素(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

基本信息
资源简介
phs000648:胰腺癌病例对照关联研究
phs000648: Pancreatic Cancer Case-Control Association Study 是一个以病例对照设计为核心的胰腺癌遗传关联研究数据集,收录于 NCBI 的 dbGaP 数据库,本站将其归类于肿瘤 / 其他类别。该数据集围绕胰腺癌展开,通过比较病例组与对照组在遗传变异上的分布差异,为探索与胰腺癌风险相关的候选因素提供数据基础。其主题标签为“Case-Control”,表明数据组织方式遵循病例对照研究的基本框架,即分别纳入患病个体与未患病个体,以便在遗传层面进行对照分析。整体而言,该数据集适用于胰腺癌相关遗传关联分析,能够支持研究者从遗传变异角度考察疾病风险的潜在影响因素,是肿瘤遗传学研究中具有明确设计导向的数据资源。
【数据集背景】
胰腺癌是一种恶性程度较高的肿瘤,其发生发展涉及遗传因素与环境因素的复杂交互。为了识别与胰腺癌风险相关的遗传变异,病例对照关联研究被广泛采用。phs000648 正是基于这一研究思路建立的数据集,其英文名称明确指向“Pancreatic Cancer Case-Control Association Study”,即胰腺癌病例对照关联研究。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究项目,源站将其描述为“dbGaP study (Case-Control)”。本站将其分类为肿瘤 / 其他,主题标签为“Case-Control”,说明该数据集在分类体系中归属于肿瘤领域,并以病例对照作为核心设计特征。该数据集的建立,旨在为胰腺癌遗传易感性研究提供可用的病例与对照样本数据,从而支持对遗传变异与疾病风险之间关联的统计分析。
【数据内容】
该数据集以病例对照设计组织数据,包含病例组与对照组,用于比较两组在遗传变异上的分布差异。其核心内容围绕胰腺癌相关遗传关联分析展开,可支持探索与胰腺癌风险相关的候选因素。主题标签“Case-Control”表明,数据在结构上区分患病个体与未患病个体,以便进行组间遗传变异频率或基因型分布的对比。源站描述仅指出其为 dbGaP study (Case-Control),未进一步说明具体的样本量、变异位点数量、测序平台或表型字段等细节。因此,关于数据内容的具体规模与变量构成,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究项目。源站描述为“dbGaP study (Case-Control)”,表明其数据采集与组织遵循 dbGaP 对病例对照研究的收录方式。本站分类为肿瘤 / 其他,主题标签为“Case-Control”。关于样本采集地点、时间范围、纳入排除标准、伦理审批信息以及具体的采集流程,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于胰腺癌相关遗传关联分析。具体而言,可用于比较病例组与对照组在遗传变异上的分布差异,进而探索与胰腺癌风险相关的候选因素。其病例对照设计使其适合开展遗传变异与疾病风险之间的关联研究,例如候选基因关联分析或全基因组关联分析的后续验证。主题标签“Case-Control”也提示该数据可用于组间比较类研究。关于是否适用于其他癌种、其他人群或特定临床终点,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以病例对照设计组织,使用时可依据病例组与对照组的划分,对遗传变异分布进行对比分析。由于源站描述仅为“dbGaP study (Case-Control)”,未提供具体的数据格式、访问方式、分析流程或推荐工具。因此,关于如何下载、如何提取变量、如何进行质量控制与统计建模等操作细节,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 研究项目,源站描述为“dbGaP study (Case-Control)”。关于样本质量、基因型 calling 质量、缺失率、批次效应、群体分层控制以及统计效力等具体质量指标,源站未提供。其限制方面,由于仅明确为病例对照设计,未说明样本量、人群构成、对照选择方式及混杂因素控制情况,源站未提供。使用时应以源站实际发布的信息为准。
【引用与许可】
该数据集英文名称为 phs000648: Pancreatic Cancer Case-Control Association Study,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站描述为“dbGaP study (Case-Control)”。关于引用格式、数据使用协议、许可条款、访问权限及是否需要申请审批等具体信息,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000648
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
dbGaP study (Case-Control).
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




