患者配对结肠癌转移细胞系模型的磷酸化蛋白质组

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD003708

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数据说明

磷酸化介导的信号网络对结肠癌转移的贡献尚不明确。为更好地理解组成性信号改变在癌症进展中的作用，我们通过LC-MS/MS比较了SW480和SW620细胞系的全局磷酸化蛋白质组。这两株患者匹配的细胞系分别来源于原发性结肠肿瘤和淋巴结转移灶。对显著改变的磷酸化位点进行网络分析，揭示了细胞黏附、有丝分裂和mRNA翻译机器等方面的差异调控。在后一组中，包括一些磷酸化蛋白质上的位点，这些蛋白质在mRNA生物发生与剪接、通过核孔的运输、翻译起始以及mRNA稳定性和降解中具有已知作用。尽管这些过程的改变与致癌转化相关，但mRNA稳定性的调控通常并未与癌症进展相关联。值得注意的是，SW620中相对变化最大的单一磷酸化位点是eIF2S2上的Ser2，提示SW620细胞比SW480细胞翻译更快或效率更高。

翻译调控的这些广泛变化也在eIF4E未过度表达的情况下发生。总而言之，这项研究表明，转移性细胞展现出磷酸蛋白质组的构成性变化，而mRNA稳定性和翻译效率可能是癌症进展过程中失调的重要靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。