PDC:非功能性胰腺神经内分泌肿瘤的蛋白质基因组学表征
PDC 项目:非功能性胰腺神经内分泌肿瘤的蛋白质基因组学表征。癌症蛋白质组学数据集(PDC/CPTAC)。主题标签:胰腺神经内分泌肿瘤、蛋白质基因组学、肿瘤、PDC、CPTAC

基本信息
资源简介
PDC:非功能性胰腺神经内分泌肿瘤的蛋白质基因组学表征
PDC: Proteogenomic characterization of non-functional pancreatic neuroendocrine tumors 是一个收录于 proteomic.datacommons.cancer.gov 的癌症蛋白质组学数据集,隶属于国际癌症蛋白质基因组联盟(International Cancer Proteogenome Consortium)框架下的 PDC/CPTAC 项目。该数据集聚焦于非功能性胰腺神经内分泌肿瘤,旨在通过蛋白质基因组学层面的表征,为理解这一肿瘤类型的分子特征提供数据支撑。其主题标签涵盖胰腺神经内分泌肿瘤、蛋白质基因组学、肿瘤、PDC 与 CPTAC,在分类上归属于肿瘤领域的其他类别。整体而言,该数据集是国际癌症蛋白质基因组联盟资源体系中的一个具体项目实例,面向肿瘤蛋白质组学研究场景。
【数据集背景】
该数据集来源于 PDC 项目,项目全称为“Proteogenomic characterization of non-functional pancreatic neuroendocrine tumors”,即非功能性胰腺神经内分泌肿瘤的蛋白质基因组学表征。其所属项目为 International Cancer Proteogenome Consortium,属于癌症蛋白质组学数据集(PDC/CPTAC)体系的一部分。非功能性胰腺神经内分泌肿瘤是胰腺神经内分泌肿瘤中的一类,蛋白质基因组学则是一种将蛋白质组学与基因组学信息相结合的研究策略,用于从蛋白层面和基因层面共同刻画肿瘤的分子特征。该数据集正是在这一研究框架下产生的。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 International Cancer Proteogenome Consortium。其侧写线索中的短描述指出,这是 PDC 项目:非功能性胰腺神经内分泌肿瘤的蛋白质基因组学表征,属于癌症蛋白质组学数据集(PDC/CPTAC),主题标签包括胰腺神经内分泌肿瘤、蛋白质基因组学、肿瘤、PDC、CPTAC。关于数据集内部具体包含的样本数量、组学层次、文件类型、数据规模等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 proteomic.datacommons.cancer.gov。源站描述表明,其为 PDC 项目“Proteogenomic characterization of non-functional pancreatic neuroendocrine tumors”,项目所属计划为 International Cancer Proteogenome Consortium,属于癌症蛋白质组学数据集(PDC/CPTAC)。关于具体的样本采集方式、实验流程、仪器平台、数据处理管线等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤蛋白质组学相关的研究场景,尤其是围绕非功能性胰腺神经内分泌肿瘤的蛋白质基因组学表征分析。其所属的国际癌症蛋白质基因组联盟框架与 PDC/CPTAC 体系,通常用于支持癌症分子机制探索、分子分型研究以及潜在生物标志物发现等方向。由于该数据集被归类为肿瘤领域的其他类别,也可作为肿瘤学研究中蛋白质基因组学数据的参考资源之一。关于该数据集在具体研究中的适用边界与推荐用途,源站未提供。
【使用方法】
关于该数据集的获取方式、访问入口、下载流程、数据格式说明以及配套分析工具等信息,源站未提供。
【质量与限制】
关于该数据集的数据质量评估、完整性说明、已知偏差、使用限制与注意事项等信息,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款与署名要求等信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://proteomic.datacommons.cancer.gov/pdc/study/a3ab45f4-8426-4a27-a429-6f5659b0d128
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
PDC project Proteogenomic characterization of non-functional pancreatic neuroendocrine tumors. Program: International Cancer Proteogenome Consortium. Cancer proteomics dataset (PDC/CPTAC).
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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