PDC：整合蛋白质基因组分析揭示胆囊癌分子特征及临床意义
PDC 项目：整合蛋白质基因组分析揭示胆囊癌分子特征及临床意义。癌症蛋白质组学数据集（PDC/CPTAC）。主题标签：胆囊癌、蛋白质基因组学、肿瘤、PDC、CPTAC
基本信息
资源简介
PDC：整合蛋白质基因组分析揭示胆囊癌分子特征及临床意义
PDC: Integrative proteogenomic analysis provides molecular insights and clinical significance in gallbladder cancer 是蛋白质组数据共享平台（Proteomic Data Commons，PDC）收录的一个癌症蛋白质组学数据集，隶属于国际癌症蛋白质基因组联盟（International Cancer Proteogenome Consortium，ICPC）框架下的 CPTAC 相关项目。该数据集以胆囊癌为研究对象，通过整合蛋白质基因组学分析，旨在揭示胆囊癌的分子特征及其临床意义。数据集来源站为 proteomic.datacommons.cancer.gov，本站分类归入肿瘤 / 其他。其主题标签为 International Cancer Proteogenome Consortium，侧写线索进一步标注了胆囊癌、蛋白质基因组学、肿瘤、PDC、CPTAC 等关键词，便于在肿瘤蛋白质组学资源中进行检索与定位。
【数据集背景】
该数据集所属项目为 PDC 项目，项目名称为 Integrative proteogenomic analysis provides molecular insights and clinical significance in gallbladder cancer。其所属计划为 International Cancer Proteogenome Consortium（国际癌症蛋白质基因组联盟）。从源站描述来看，该数据集被明确标识为癌症蛋白质组学数据集（PDC/CPTAC），说明其处于 PDC 与 CPTAC 相关资源体系之中。胆囊癌是一种相对少见但恶性程度较高的胆道系统肿瘤，围绕其开展整合蛋白质基因组分析，有助于从蛋白质与基因组等多个分子层面理解肿瘤发生发展机制，并探索与临床相关的分子标志或分型线索。该数据集的设立背景即在于通过蛋白质基因组学手段，为胆囊癌的分子特征与临床意义研究提供数据支撑。
【数据内容】
源站描述仅表明该数据集为癌症蛋白质组学数据集（PDC/CPTAC），并指出其主题为整合蛋白质基因组分析揭示胆囊癌分子特征及临床意义。关于具体的样本数量、组学层次、蛋白质鉴定数量、基因突变谱、临床随访信息、数据文件类型与规模等详细内容，源站未提供。因此，本数据集在数据内容层面的具体构成，需以源站实际发布的数据文件与说明为准。
【采集与来源】
该数据集来源于 proteomic.datacommons.cancer.gov，即 PDC 平台。源站描述将其归为 PDC 项目，并标注计划为 International Cancer Proteogenome Consortium，同时说明其为癌症蛋白质组学数据集（PDC/CPTAC）。关于样本采集地点、采集时间、纳入排除标准、伦理审批信息、样本处理流程、质谱平台与实验方案等具体采集与来源细节，源站未提供。
【适用场景】
基于源站描述与主题标签，该数据集适用于胆囊癌相关的蛋白质基因组学分析场景，可用于探索胆囊癌的分子特征及其临床意义。其所属的 ICPC 与 PDC/CPTAC 背景，也使其适合在癌症蛋白质组学比较研究、跨癌种分子特征分析以及蛋白质基因组整合方法学研究中作为数据资源使用。关于具体的适用分析类型、可支持的临床研究问题以及推荐的应用方向，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、访问入口、文件格式说明、分析流程、所需工具与软件、数据预处理步骤等。使用者如需使用，应以源站发布的使用说明与数据访问政策为准。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息与使用限制说明，包括数据完整性、样本代表性、技术重复、批次效应、临床注释完整度以及任何使用约束等。相关质量与限制信息需以源站实际说明为准。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可条款信息。使用者在引用或再利用该数据集时，应查阅源站发布的引用规范与许可政策。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://proteomic.datacommons.cancer.gov/pdc/study/7d66feb6-f673-4250-87ea-c5aa2f12c051
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
PDC project Integrative proteogenomic analysis provides molecular insights and clinical significance in gallbladder cancer. Program: International Cancer Proteogenome Consortium. Cancer proteomics dataset (PDC/CPTAC).
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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