PDC:韩国国家癌症中心癌症蛋白质基因组学组

PDC 项目:韩国国家癌症中心癌症蛋白质基因组学组。癌症蛋白质组学数据集(PDC/CPTAC)。主题标签:癌症蛋白质组学、蛋白质基因组学、肿瘤

pdc
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基因组癌症蛋白质组学蛋白质基因组学肿瘤
PDC: Cancer Proteogenomics  Group of National Cancer Center Korea

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

PDC:韩国国家癌症中心癌症蛋白质基因组学组

PDC: Cancer Proteogenomics Group of National Cancer Center Korea 是蛋白质组数据共享平台 PDC(Proteomic Data Commons)中的一个项目条目,隶属于国际癌症蛋白质基因组联盟(International Cancer Proteogenome Consortium)。该数据集聚焦于韩国国家癌症中心癌症蛋白质基因组学组所产出的癌症蛋白质组学数据,属于肿瘤领域的蛋白质基因组学研究资源。其内容围绕癌症样本的蛋白质组学与蛋白质基因组学分析展开,旨在为肿瘤研究提供可共享、可复用的数据支持。该数据集在分类上归入肿瘤及其他相关类别,主题标签为国际癌症蛋白质基因组联盟,并涉及癌症蛋白质组学、蛋白质基因组学与肿瘤等方向。

【数据集背景】

该数据集来源于 PDC 平台,项目名称为 Cancer Proteogenomics Group of National Cancer Center Korea。其所属计划为国际癌症蛋白质基因组联盟(International Cancer Proteogenome Consortium)。该联盟致力于推动癌症蛋白质基因组学研究的国际合作与数据共享。韩国国家癌症中心癌症蛋白质基因组学组作为该联盟的参与方,产出了这一癌症蛋白质组学数据集。该数据集属于 PDC/CPTAC 相关数据体系,是肿瘤蛋白质组学与蛋白质基因组学领域的一项国际协作成果。

【数据内容】

该数据集为癌症蛋白质组学数据集,涉及蛋白质组学与蛋白质基因组学内容。其主题标签包括国际癌症蛋白质基因组联盟,并关联癌症蛋白质组学、蛋白质基因组学、肿瘤等方向。数据集的具体样本数量、癌种类型、组学层次、文件格式、数据规模等详细信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 proteomic.datacommons.cancer.gov,即 PDC 平台。项目归属为韩国国家癌症中心癌症蛋白质基因组学组,所属计划为国际癌症蛋白质基因组联盟。数据来源站为 PDC,属于 PDC/CPTAC 体系下的癌症蛋白质组学数据集。关于样本采集地点、采集时间、采集流程、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于癌症蛋白质组学与蛋白质基因组学相关研究,可服务于肿瘤领域的蛋白质组数据分析、蛋白质基因组学整合分析以及国际癌症蛋白质基因组联盟框架下的比较研究与协作研究。其主题标签表明其可用于癌症蛋白质组学、蛋白质基因组学及肿瘤相关方向。具体适用场景的详细说明,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 PDC 平台(proteomic.datacommons.cancer.gov)发布与获取。用户可访问该来源站了解项目详情并获取数据。关于数据下载方式、访问权限、所需工具、分析流程等具体使用方法,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 PDC 项目下的癌症蛋白质组学数据集,属于 PDC/CPTAC 体系。关于数据质量评估指标、数据完整性、样本量、技术平台、数据版本、已知偏差或限制等信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集所属计划为国际癌症蛋白质基因组联盟,来源站为 PDC。关于引用格式、许可协议、使用条款、数据共享政策等具体信息,源站未提供。

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源站:https://proteomic.datacommons.cancer.gov/pdc/study/ed3662d9-18ca-4881-9b7e-92853f14e34c

标准获取流程:

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

PDC project Cancer Proteogenomics Group of National Cancer Center Korea. Program: International Cancer Proteogenome Consortium. Cancer proteomics dataset (PDC/CPTAC).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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