NCI60 细胞系定量蛋白质组图谱（PCT-SWATH）
该数据集在分类上归属于肿瘤 / 其他，来源站为 ebi.ac.uk，属于依托公共数据平台发布与共享的研究资源。从整体定位看，它围绕 NCI-60 这一广泛使用的癌细胞系集合，提供定量蛋白质组层面的数据资源，可用于肿瘤相关的基础研究、方法学比较以及数据再利用
基本信息
资源简介
NCI60 细胞系定量蛋白质组图谱（PCT-SWATH）
NCI60 proteome by PCT-SWATH - Quantitative Proteome Landscape of the NCI-60 Cancer Cell Lines 是一个面向肿瘤研究领域的公开蛋白质组学数据集，英文名称已明确指向其核心内容：以 PCT-SWATH 技术路线获取的 NCI-60 癌细胞系定量蛋白质组图谱。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 其他，来源站为 ebi.ac.uk，属于依托公共数据平台发布与共享的研究资源。从整体定位看，它围绕 NCI-60 这一广泛使用的癌细胞系集合，提供定量蛋白质组层面的数据资源，可用于肿瘤相关的基础研究、方法学比较以及数据再利用。该数据集以公开数据集形式发布，具备明确的来源标识和引用信息，便于研究者在遵守相应引用要求的前提下获取和使用。以下将从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
该数据集的主题涵盖肿瘤，属于肿瘤研究领域中与蛋白质组学相关的公开数据资源。NCI-60 是肿瘤研究中常用的一组癌细胞系，围绕该细胞系集合产生的组学数据常被用于探索肿瘤细胞在分子层面的差异与特征。本数据集以“Quantitative Proteome Landscape of the NCI-60 Cancer Cell Lines”为题，表明其关注的是 NCI-60 癌细胞系的定量蛋白质组全景。数据集由 Tiannan Guo 于 2020 年发布，来源站为 ebi.ac.uk，属于该平台收录的公开数据集之一。其分类归入肿瘤 / 其他，说明在应用领域上主要服务于肿瘤相关研究，同时在数据类型的细分上并未归入更具体的子类。该数据集的发布为肿瘤蛋白质组研究提供了一个可公开访问的数据资源，便于后续研究进行查阅、引用和再利用。
【数据内容】
该数据集的核心内容为 NCI-60 癌细胞系的定量蛋白质组数据，采用 PCT-SWATH 技术路线获得。标题中的“proteome”与“Quantitative Proteome Landscape”表明其内容围绕蛋白质组的定量刻画展开，而非仅提供定性鉴定结果。数据集英文名中同时出现“NCI60 proteome by PCT-SWATH”和“Quantitative Proteome Landscape of the NCI-60 Cancer Cell Lines”，两者共同指向同一主题，即 NCI-60 细胞系的蛋白质组定量图谱。关于具体的蛋白质数量、样本数量、定量指标、覆盖深度、实验重复数等细节，源站未提供。该数据集在分类上属于肿瘤 / 其他，主题涵盖肿瘤，因此其内容在应用层面与肿瘤研究直接相关。除上述已明确的信息外，数据内容的具体组成、文件格式、数据表结构等，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk，源站描述中给出了数据集的正式引用信息：Tiannan Guo (2020). NCI60 proteome by PCT-SWATH - Quantitative Proteome Landscape of the NCI-60 Cancer Cell Lines [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD003539。由此可知，该数据集通过 ebi.ac.uk 平台发布，并具有明确的发布年份和作者信息。数据集名称中的 PCT-SWATH 指明了其采集所依托的技术路线，但关于样本制备流程、仪器平台、色谱与质谱参数、数据采集软件、实验设计细节等，源站未提供。该数据集的来源标识清晰，便于使用者追溯至原始发布页面并获取进一步信息。除来源站、引用信息和标题中体现的技术路线外，采集过程的具体信息源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤研究领域中与蛋白质组学相关的分析工作。由于主题涵盖肿瘤，且内容为 NCI-60 癌细胞系的定量蛋白质组图谱，其潜在应用方向包括肿瘤细胞系的蛋白质组特征研究、不同细胞系之间的定量比较、蛋白质组数据的二次分析以及与其他组学数据的整合探索。数据集分类为肿瘤 / 其他，说明其可服务于肿瘤领域的广泛研究需求，而不局限于某一特定子方向。对于关注 NCI-60 细胞系的研究者而言，该数据集可作为公开的蛋白质组数据资源加以利用。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物开发、生物标志物验证等具体应用，源站未提供明确说明，因此不应作超出已述范围的推断。
【使用方法】
该数据集为公开数据集，来源站为 ebi.ac.uk，使用者可通过源站描述中给出的链接 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD003539 访问该数据集页面。关于数据的下载方式、文件组织、格式说明、预处理步骤、分析工具推荐以及使用教程等，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应参照其正式引用信息进行标注。除访问链接和引用信息外，具体的使用流程与操作说明源站未提供。
【质量与限制】
该数据集由 Tiannan Guo 于 2020 年发布，来源站为 ebi.ac.uk，具有明确的来源与引用信息。其标题表明数据内容为 NCI-60 癌细胞系的定量蛋白质组图谱，采用 PCT-SWATH 技术路线。关于数据质量评估指标、缺失值情况、定量准确性、重复性、批次效应、覆盖范围以及可能的偏差等，源站未提供。该数据集分类为肿瘤 / 其他，主题涵盖肿瘤，使用者在将其应用于特定研究问题时，应结合自身研究设计判断其适用性。除已述信息外，关于数据质量的评价与使用限制，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的正式引用信息为：Tiannan Guo (2020). NCI60 proteome by PCT-SWATH - Quantitative Proteome Landscape of the NCI-60 Cancer Cell Lines [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD003539。使用者在利用该数据集时，应按照上述引用信息进行规范引用。关于该数据集的许可协议、使用条款、再分发条件以及商业使用限制等，源站未提供。除引用信息外，许可相关的具体规定源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD003539
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Tiannan Guo (2020). NCI60 proteome by PCT-SWATH - Quantitative Proteome Landscape of the NCI-60 Cancer Cell Lines [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD003539
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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