SIX1/2通路与DROSHA/DGCR8 miRNA微处理器复合体突变驱动高危胚芽型Wilms瘤

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-60081

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

接受化疗的儿童Wilms瘤（肾母细胞瘤）中，胚芽型组织学与不良预后相关。为揭示该患者亚群潜在的肿瘤生物学特征并寻找新的治疗线索，我们通过外显子组和转录组测序分析了58例胚芽型Wilms瘤，并在一个大型独立复制队列中验证了我们的发现。所识别的复发突变（包括体细胞突变和生殖系突变）包括：在高增殖潜能肿瘤中SIX1和SIX2同源结构域的热点突变（Q177R）、微处理器基因如DROSHA、DGCR8、DICER1和DIS3L2的突变，以及IGF2、MYCN和TP53的改变，其中TP53改变与极差预后强烈相关。DROSHA和DGCR8突变对肿瘤中miRNA表达模式有强烈影响，并在转染突变型DROSHA的细胞系中进行了功能验证。共分析样本16例，每例均作为技术重复进行。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。