SKNMC ES细胞系中MMP14下调转录组图谱

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE173147

标准获取流程：

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   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

内皮联蛋白（ENG）是一种间充质干细胞（MSC）标志物，主要在活跃的内皮细胞及某些癌症类型中高表达。这种跨膜蛋白可被基质金属蛋白酶14（MMP14）从细胞表面脱落至细胞外空间。此前，已在尤文肉瘤（ES）患者样本中鉴定出ENG的表达；ES是一种骨/软组织肿瘤，推测起源于间充质干细胞。ES是一种主要的儿童恶性肿瘤，诊断时转移发生率较高，约30%的患者伴有不良预后。当前化疗方案对晚期疾病难以取得显著疗效，这一现状使情况更加严峻。在ES的临床治疗背景下，靶向治疗展现出强烈的吸引力。鉴于高比例的患者在细胞表面呈现ENG表达，针对ENG的抗体-药物偶联物（ADC）已被研究。抗ENG ADC在体内和体外ES模型中均发挥了ENG依赖性和剂量依赖性的抗增殖作用。这些结果提示，使用ENG-ADC可能在ES治疗中具有潜在获益。

由于ENG和MMP14在ES患者中的表达存在差异，因此在一组82名患者队列中进行了生存研究，该队列根据其临床阶段（原发、化疗后原发、转移和复发）进行分类。ENG和MMP14均与较差的预后相关。功能实验表明，ENG调节迁移，可能通过应力纤维和丝状伪足中肌动蛋白的正确组装，同时对细胞的粘附能力产生伴随影响。此外，ENG被证实通过促进粘着斑激酶磷酸化和蛋白激酶C表达，在粘着斑信号传导的激活中起重要作用。总体而言，这些结果表明ENG作为衔接蛋白在ES细胞正确的迁移机制中发挥主要作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。