基于游离DNA简化代表性亚硫酸氢盐测序的儿童实体瘤微创分类：原理验证研究

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基于游离DNA简化代表性亚硫酸氢盐测序的儿童实体瘤微创分类：原理验证研究

该数据集名为“Minimally invasive classification of pediatric solid tumors using reduced representation bisulfite sequencing of cell-free DNA: a proof-of-principle study”，属于肿瘤/其他分类，来源于omicsdi.org。数据集包含60例儿童癌症样本的游离DNA简化代表性亚硫酸氢盐测序（RRBS）处理后数据，目的是根据组织病理学诊断对这些样本进行分类。数据以bismark coverage格式提供，样本在NextSeq 500平台上完成测序。该数据集为概念验证性研究，主题标签为Transcriptomics，相关数据与bioRxiv预印本10.1101/795047v2对应。

【数据集背景】

该数据集是一项概念验证性研究（proof-of-principle study）的配套数据，研究主题为利用游离DNA的简化代表性亚硫酸氢盐测序（RRBS）对儿童实体瘤进行微创分类。研究的核心思路是通过检测游离DNA的甲基化相关信息，尝试依据组织病理学诊断对儿童癌症样本进行分类。数据集所属分类为肿瘤/其他，主题标签为Transcriptomics。源站未提供更多关于研究背景、临床意义或方法学设计细节的描述。

【数据内容】

数据集包含60例儿童癌症样本的游离DNA简化代表性亚硫酸氢盐测序处理后数据。文件以bismark coverage格式提供，属于处理后数据而非原始测序读段。样本在NextSeq 500平台上测序。源站未提供关于文件数量、文件大小、覆盖度指标、样本临床信息、分组构成或具体数据字段的进一步说明。

【采集与来源】

数据来源于omicsdi.org，源站描述指向bioRxiv预印本https://www.biorxiv.org/content/10.1101/795047v2.full。样本为儿童癌症样本的游离DNA，共60例。测序平台为NextSeq 500。源站未提供样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、纳入排除标准或具体机构信息。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集适用于围绕儿童实体瘤微创分类的概念验证性分析，尤其是利用游离DNA RRBS处理后数据进行组织病理学诊断相关分类的研究场景。bismark coverage格式数据可用于下游甲基化覆盖度相关分析。主题标签为Transcriptomics，但源站未提供该数据集在转录组学分析中的具体适用方式。源站未提供其他适用场景的说明。

【使用方法】

数据以bismark coverage格式提供，使用者可依据该格式的通用规范进行读取和处理。源站未提供具体的分析流程、软件参数、参考基因组版本、标准化步骤或使用示例。源站未提供数据下载方式、文件组织结构和访问入口的详细说明。

【质量与限制】

该研究为概念验证性研究，样本量为60例儿童癌症样本。源站未提供测序质量指标、覆盖度统计、重复性评估、批次效应信息或数据完整性说明。源站未提供该数据集在临床诊断应用中的验证情况或性能指标。使用者应注意其概念验证性质，源站未提供关于数据适用范围限制的进一步描述。

【引用与许可】

源站描述指向bioRxiv预印本https://www.biorxiv.org/content/10.1101/795047v2.full，使用时应参考该预印本。源站未提供数据许可协议、使用条款、引用格式或数据再分发规定的具体信息。