台湾肝癌肿瘤与癌旁组织甲基化数据集
该数据集来自 omicsdi.org，收录 62 例台湾肝细胞癌（HCC）患者的肿瘤组织与癌旁非肿瘤组织，使用 Illumina HumanMethylation 27 芯片检测 DNA 甲基化水平
基本信息
资源简介
台湾肝癌肿瘤与癌旁组织甲基化数据集
该数据集来自 omicsdi.org，收录 62 例台湾肝细胞癌（HCC）患者的肿瘤组织与癌旁非肿瘤组织，使用 Illumina HumanMethylation 27 芯片检测 DNA 甲基化水平。经 Bonferroni 校正后，共发现 2,324 个 CpG 位点甲基化水平显著差异，其中肿瘤组织相对非肿瘤组织有 684 个位点显著高甲基化、1,640 个位点低甲基化；并对其中 5 个基因的子集用焦磷酸测序验证，相关系数为 0.92 至 0.97。数据可用于肝癌甲基化差异分析、候选标志物筛选及转录组学相关研究（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们使用 Illumina HumanMethylation 27 芯片分析了 62 例台湾 HCC 病例的肿瘤组织与癌旁非肿瘤组织。经 Bonferroni 校正后，共有 2,324 个 CpG 位点的甲基化水平存在显著差异，其中肿瘤组织相对非肿瘤组织有 684 个 CpG 位点显著高甲基化、1,640 个位点低甲基化。芯片数据在其中的 5 个基因子集中通过焦磷酸测序进行了验证；相关系数范围为 0.92 至 0.97。62 份肿瘤组织和 62 份癌旁非肿瘤组织。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-37988
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
我们使用Illumina HumanMethylation 27芯片分析了62例台湾HCC病例的肿瘤及癌旁非肿瘤组织。经Bonferroni校正后，共有2,324个CpG位点的甲基化水平存在显著差异，其中肿瘤组织相比非肿瘤组织有684个CpG位点显著高甲基化，1,640个位点低甲基化。我们通过焦磷酸测序对其中5个基因的芯片数据进行了验证；相关系数范围为0.92至0.97。62份肿瘤组织和62份癌旁非肿瘤组织
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