Mdm2通过多梳抑制复合物2以不依赖p53的方式增强促进干性的染色质修饰[HCT116微阵列]

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/其他分类,主题为转录组学。源站描述围绕 Mdm2 在不依赖 p53 的情况下通过 Polycomb Repressor Complex 2(PRC2)及其催化组分 EZH2 增强促干性染色质修饰展开,涉及小鼠胚胎成纤维细胞来源 iPSCs 生成、人间充

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
Mdm2 enhances stemness-promoting chromatin modifications through the Polycomb Repressor Complex 2 in a p53-Independent Manner [HCT116 microarray]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-31

资源简介

Mdm2通过多梳抑制复合物2以不依赖p53的方式增强促进干性的染色质修饰[HCT116微阵列]

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/其他分类,主题为转录组学。源站描述围绕 Mdm2 在不依赖 p53 的情况下通过 Polycomb Repressor Complex 2(PRC2)及其催化组分 EZH2 增强促干性染色质修饰展开,涉及小鼠胚胎成纤维细胞来源 iPSCs 生成、人间充质干细胞分化及癌细胞克隆存活等实验背景。数据可用于研究 Mdm2 与 PRC2/EZH2 在染色质修饰(H3K27me3、H2AK119 泛素化)及干性调控中的关联(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Mdm2 癌蛋白可泛素化并拮抗 p53,但也可能执行不依赖 p53 的功能。本文报道,在缺乏 p53 的情况下,Mdm2 是小鼠胚胎成纤维细胞高效生成诱导多能干细胞(iPSCs)所必需的。类似地,在 p53 缺陷背景下敲低 Mdm2 也促进人间充质干细胞分化,并降低癌细胞的克隆存活。大多数受 Mdm2 控制的基因也对 Polycomb Repressor Complex 2(PRC2)及其催化组分 EZH2 的失活产生响应。Mdm2 在染色质上与 EZH2 物理结合,增强其靶基因上组蛋白 H3 第 27 位赖氨酸的三甲基化以及组蛋白 H2A 第 119 位赖氨酸(H2AK119)的泛素化。同时去除 Mdm2 与 H2AK119 E3 连接酶 Ring1B/RNF2 进一步诱导这些基因,并产生合成性致

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-73294

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Mdm2癌蛋白能够泛素化并拮抗p53,但也可能执行不依赖p53的功能。在此我们报道,在缺乏p53的情况下,Mdm2对于从小鼠胚胎成纤维细胞高效生成诱导多能干细胞(iPSCs)是必需的。同样,在p53缺陷背景下敲低Mdm2也促进了人间充质干细胞的分化,并降低了癌细胞的克隆形成存活能力。大多数受Mdm2控制的基因也对Polycomb抑制复合物2 (PRC2)及其催化组分EZH2的失活产生响应。Mdm2在染色质上与EZH2物理结合,增强其靶基因上组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化以及组蛋白H2A第119位赖氨酸(H2AK119)的泛素化。同时去除Mdm2与H2AK119 E3连接酶Ring1B/RNF2进一步诱导了这些基因,并协同性地阻滞了细胞增殖。总之,Mdm2以不依赖p53的方式支持Polycomb介导的对谱系特异性基因的抑制。HCT116 p53-/-细胞中的微阵列分析

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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