黑色素瘤液体活检数据集
14名IV期黑色素瘤患者的30个肿瘤及液体活检样本的NGS数据，涵盖靶向治疗或免疫治疗。
基本信息
资源简介
黑色素瘤液体活检数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Liquid biopsy in melanoma》。配套论文《NGS Analysis of Liquid Biopsy (LB) and Formalin-Fixed Paraffin-Embedded (FFPE) Melanoma Samples Using Oncomine™ Pan-Cancer Cell-Free Assay》发表于 Genes（2021），DOI：10.3390/genes12071080。源站首次发布：2021-07-19。
【数据内容】
源站原始描述：NGS data of 30 melanoma samples (tumor and liquid biopsy) derived from 14 stage IV melanoma patients treated with targeted therapy or immunotherapy
【数据结构与技术规格】
文件数 31 个，合计 160.50 GB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.14994141.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Genomics、Genetics not elsewhere classified。主题标签：NGS, liquid biopsy, melanoma、Genomics、Genetics。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Liquid_biopsy_in_melanoma/14994141
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Olbryt, Magdalena (2021). Liquid biopsy in melanoma. figshare. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-04，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Liquid biopsy in melanoma
- DOI：10.6084/m9.figshare.14994141.v1
- 发布日期：2021-07-19
- 文件数：31 个
- 文件总体积：160.50 GB
- 源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Liquid_biopsy_in_melanoma/14994141
命令行下载
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文件清单
Patient_1_LB1_R_2021_01_15_09_47_11_user_GSS5-0115-38-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_17.bam（7.47 GB）Patient_1_LB2_R_2021_01_15_09_47_11_user_GSS5-0115-38-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_19.bam（8.31 GB）Patient_1_TUMOR_R_2021_02_19_13_01_39_user_GSS5-0115-42-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_18.bam（4.12 GB）Patient_2_LB1_R_2021_01_05_09_40_31_user_GSS5-0115-36-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_5.bam（190.28 MB）Patient_2_LB1_R_2021_03_17_09_39_42_user_GSS5-0115-45-Oncomine_TagSeq_Liquid_Biopsy.TagSequencing_5.bam（5.73 GB）Patient_2_LB2_R_2021_01_05_09_40_31_user_GSS5-0115-36-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_6.bam（9.38 GB）Patient_2_TUMOR_R_2021_02_19_13_01_39_user_GSS5-0115-42-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_5.bam（2.33 GB）Patient_3_LB2_R_2021_02_19_10_22_30_user_GSS5-0115-41-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_22.bam（7.35 GB）Patient_3_TUMOR_R_2021_02_19_13_01_39_user_GSS5-0115-42-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_8.bam（2.55 GB）Patient_3_LB1_R_2021_02_19_10_22_30_user_GSS5-0115-41-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_1.bam（7.25 GB）Patient_4_TUMOR_R_2021_02_19_13_01_39_user_GSS5-0115-42-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_17.bam（4.30 GB）Patient_4_LB1_R_2021_03_17_09_39_42_user_GSS5-0115-45-Oncomine_TagSeq_Liquid_Biopsy.TagSequencing_20.bam（5.16 GB）Patient_4_LB2_R_2021_02_19_10_22_30_user_GSS5-0115-41-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_6.bam（7.26 GB）Patient_5_LB1_R_2021_01_15_09_47_11_user_GSS5-0115-38-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_16.bam（9.01 GB）Patient_5_LB2_R_2021_03_17_09_39_42_user_GSS5-0115-45-Oncomine_TagSeq_Liquid_Biopsy.TagSequencing_23.bam（4.53 GB）Patient_6_TUMOR_R_2021_02_19_13_01_39_user_GSS5-0115-42-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_9.bam（2.56 GB）Patient_6_LB1_R_2021_01_05_09_40_31_user_GSS5-0115-36-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_2.bam（161.36 MB）Patient_7_LB1_R_2020_12_18_10_07_45_user_GSS5-0115-35-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_3.bam（5.95 GB）Patient_7_TUMOR_R_2021_02_19_13_01_39_user_GSS5-0115-42-Oncomine_TagSeq_S540_Liquid_Biopsy.TagSequencing_10.bam（2.87 GB）Patient_8_LB1_R_2021_03_17_09_39_42_user_GSS5-0115-45-Oncomine_TagSeq_Liquid_Biopsy.TagSequencing_4.bam（5.44 GB）
文件总体积 160.50 GB（源站 API 实测）。
数据说明
NGS data of 30 melanoma samples (tumor and liquid biopsy) derived from 14 stage IV melanoma patients treated with targeted therapy or immunotherapy.
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.14994141.v1（source: https://figshare.com/articles/dataset/Liquid_biopsy_in_melanoma/14994141）。
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