SF-1与RNF31敲低对肾上腺皮质癌细胞类固醇生成、TGFβ及Wnt/β-catenin信号通路组分的影响

数据围绕肾上腺皮质 NCI-H295R 细胞中 SF-1 或 RNF31 经 RNA 干扰敲低后的全基因组基因表达分析,涉及胆固醇代谢、类固醇激素合成以及 SF-1 与 TGFβ、Wnt/β-catenin 信号通路的负向交互

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2023-05-31 更新
浏览 15
时间序列分类knockdownsf-1rnf31affectscomponentssignalingadrenocorticalcarcinomacells
Knockdown of SF-1 and RNF31 Affects Components of Steroidogenesis, TGFβ, and Wnt/β-catenin Signaling in Adrenocortical Carcinoma Cells

基本信息

模态
时间序列
大小
0.000669001 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-31
版本
v1

资源简介

SF-1与RNF31敲低对肾上腺皮质癌细胞类固醇生成、TGFβ及Wnt/β-catenin信号通路组分的影响

Knockdown of SF-1 and RNF31 Affects Components of Steroidogenesis, TGFβ, and Wnt/β-catenin Signaling in Adrenocortical Carcinoma Cells

该数据集来自 plos.figshare.com,包含 11 个文件,以 Table_S1.pdf 至 Table_S8.pdf 等表格为主,配套论文于 2012 年发表于 PLoS ONE。数据围绕肾上腺皮质 NCI-H295R 细胞中 SF-1 或 RNF31 经 RNA 干扰敲低后的全基因组基因表达分析,涉及胆固醇代谢、类固醇激素合成以及 SF-1 与 TGFβ、Wnt/β-catenin 信号通路的负向交互。可用于研究 SF-1 在肾上腺皮质中的调控作用、RNF31 作为 SF-1 共调节因子的功能,以及相关信号通路在肾上腺皮质癌中的表达变化(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Knockdown of SF-1 and RNF31 Affects Components of Steroidogenesis, TGFβ, and Wnt/β-catenin Signaling in Adrenocortical Carcinoma Cells》发表于 PLoS ONE(2012),DOI:10.1371/journal.pone.0032080。源站首次发布:2012-03-09。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):孤儿核受体类固醇生成因子-1(SF-1,NR5A1)是肾上腺皮质和性腺发育与稳态的关键调节因子。我们最近发现,一个包含 E3 泛素连接酶 RNF31 和已知 SF-1 共抑制因子 DAX-1(NR0B1)的复合物在靶启动子上与 SF-1 相互作用,并抑制类固醇生成急性调节蛋白(StAR)和芳香化酶(CYP19)基因的转录。为进一步评估 SF-1 在肾上腺皮质中的作用以及 RNF31 在 SF-1 依赖通路中的参与,我们对使用 RNA 干扰敲低 SF-1 或 RNF31 的肾上腺皮质 NCI-H295R 细胞进行了全基因组基因表达分析。我们发现 RNF31 与胆固醇代谢和类固醇激素合成密切相关,强化了其作为 SF-1 共调节因子的作用。我们还发现 SF-1 与两者之间存在负向交互作用的有趣证据

【数据结构与技术规格】

文件数 11 个,合计 669.00 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0032080。

【主题与分类】

源站学科分类:Physiology、Molecular Biology、Biological Sciences、Cancer。主题标签:knockdown、sf-1、rnf31、affects、components、signaling、adrenocortical、carcinoma、cells。本站分类:肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Physiology、Molecular Biology、Biological Sciences、Cancer。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Knockdown_of_SF_1_and_RNF31_Affects_Components_of_Steroidogenesis_TGF_and_Wnt_catenin_Signaling_in_Adrenocortical_Carcinoma_Cells/127983

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Ehrlund, Anna; Jonsson, Philip; Vedin, Lise-Lotte; Williams, Cecilia; Gustafsson, Jan-Åke; Treuter, Eckardt (2016). Knockdown of SF-1 and RNF31 Affects Components of Steroidogenesis, TGFβ, and Wnt/β-catenin Signaling in Adrenocortical Carcinoma Cells. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "Table_S3.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/344099"
curl -L -o "Table_S4.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/344151"
curl -L -o "Table_S5.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/344196"
curl -L -o "Table_S6.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/344238"
curl -L -o "Table_S7.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/344293"
curl -L -o "Table_S8.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/344337"

文件清单

  • Table_S1.pdf(59.98 KB)
  • Table_S2.pdf(63.70 KB)
  • Table_S3.pdf(60.09 KB)
  • Table_S4.pdf(60.23 KB)
  • Table_S5.pdf(60.94 KB)
  • Table_S6.pdf(59.79 KB)
  • Table_S7.pdf(58.20 KB)
  • Table_S8.pdf(61.34 KB)
  • Table_S9.pdf(69.25 KB)
  • Table_S10.pdf(58.43 KB)
  • Table_S11.pdf(57.05 KB)

文件总体积 669.00 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

孤儿核受体类固醇生成因子-1(SF-1,NR5A1)是肾上腺皮质和性腺发育与稳态的关键调节因子。我们最近发现,一个包含E3泛素连接酶RNF31和已知SF-1辅阻遏物DAX-1(NR0B1)的复合物,在靶启动子上与SF-1相互作用,并抑制类固醇生成急性调节蛋白(StAR)和芳香化酶(CYP19)基因的转录。为进一步评估SF-1在肾上腺皮质中的作用以及RNF31参与SF-1依赖性通路的情况,我们对经RNA干扰敲低SF-1或RNF31的肾上腺皮质NCI-H295R细胞进行了全基因组基因表达分析。我们发现RNF31与胆固醇代谢和类固醇激素合成密切相关,强化了其作为SF-1共调节因子的作用。我们还发现了SF-1与转化生长因子(TGF)β及Wnt/β-catenin信号通路之间存在负向交叉对话的有趣证据。这种交叉对话可能对肾上腺性腺发育、肾上腺皮质祖细胞的维持以及肾上腺皮质癌的发生具有重要意义。

最后,SF-1基因表达谱可用于区分恶性与良性肾上腺皮质肿瘤,这一发现表明SF-1与恶性肾上腺皮质癌的发展有关。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0032080(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Knockdown_of_SF_1_and_RNF31_Affects_Components_of_Steroidogenesis_TGF_and_Wnt_catenin_Signaling_in_Adrenocortical_Carcinoma_Cells/127983)。

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