ICGC 食管腺癌测序数据 - chemo_cohort - 样本

该数据集为 ICGC 食管腺癌组织样本的测序数据,属于 chemo_cohort 队列,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics

omicsdi
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基因组Genomics
ICGC Oesophageal Adenocarcinoma sequence data - chemo_cohort - samples

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

ICGC 食管腺癌测序数据 - chemo_cohort - 样本

ICGC Oesophageal Adenocarcinoma sequence data - chemo_cohort - samples 是一个聚焦于食管腺癌的肿瘤测序数据集,收录于 omicsdi.org,在本站归入“肿瘤 / 其他”分类。该数据集提供 ICGC 食管腺癌组织样本的测序数据,所属队列为 chemo_cohort,主题标签为 Genomics。从命名与来源描述可以看出,它面向基因组学层面的研究需求,围绕食管腺癌组织样本的序列信息组织数据,适合作为该癌种分子特征分析与后续挖掘的基础数据资源。以下从背景、内容、来源、用途、使用方式及限制等方面作进一步说明。

【数据集背景】

该数据集以 ICGC 食管腺癌为背景,名称中明确标注了 Oesophageal Adenocarcinoma,即食管腺癌,并指明其属于 chemo_cohort 队列。ICGC 是国际上知名的癌症基因组研究计划,该数据集延续了这一框架下对肿瘤样本进行测序研究的思路,将关注点落在食管腺癌组织样本上。主题标签为 Genomics,表明其核心内容属于基因组学范畴。在本站分类中,它被归入“肿瘤 / 其他”,说明其定位为肿瘤相关数据资源中的一类专门测序数据集合。

【数据内容】

数据集的内容为食管腺癌组织样本的测序数据,对应 chemo_cohort 队列。数据以样本为单位组织,名称中的 samples 提示其提供的是样本层面的序列数据集合。主题标签 Genomics 进一步说明数据性质属于基因组学测序结果。除上述范围性描述外,关于具体样本数量、测序平台、读长、覆盖度、文件格式及数据规模等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。源站对其的描述为:Sequencing data for ICGC Oesophageal Adenocarcinoma tissue samples - chemo_cohort,即 ICGC 食管腺癌组织样本(chemo_cohort 队列)的测序数据。数据由 omicsdi.org 这一平台收录与呈现,本站据此进行分类与展示。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息及具体测序机构等,源站未提供。

【适用场景】

基于其肿瘤基因组测序数据的属性,该数据集可用于食管腺癌相关的基因组学研究,例如对组织样本测序结果的再分析、队列层面的分子特征比较,以及作为方法验证或分析流程测试的数据来源。由于标注了 chemo_cohort 队列,其数据也适合围绕该队列开展针对性的探索性分析。需要说明的是,上述用途为基于数据类型的通用方向,源站未提供该数据集的具体应用案例或验证结论。

【使用方法】

该数据集通过 omicsdi.org 提供,使用者可前往该来源站获取数据。关于具体的下载方式、访问协议、文件组织结构和分析工具建议,源站未提供。使用前建议先查阅来源站上的数据集页面,确认可获取的数据范围与格式。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估信息,包括数据完整性、测序质量指标、样本注释完整度等。同时,样本量、队列构成细节及数据更新情况亦未说明。使用者应结合来源站的原始说明自行判断数据适用性。本介绍仅依据可获得的信息撰写,未对数据质量作任何推断。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可条款。使用者在引用或再分发数据前,应查阅 omicsdi.org 上对应数据集页面的说明,或联系数据提供方确认相关要求。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001002241

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Sequencing data for ICGC Oesophageal Adenocarcinoma tissue samples - chemo_cohort

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