HNC-PREDICTOR数据集:头颈癌放疗患者大规模临床与影像组学数据

该数据集来自figshare,包含3027例在MD Anderson Cancer Center接受根治性放疗的头颈癌患者的临床变量,并提供影像生物标志物数据及建模脚本与模型文件

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2023-05-31 更新
浏览 2
其他预测radiotherapyRadiomicsoutcome prediction toolshead and neck cancersmachine learning-basedRadiation Therapy
HNC-PREDICTOR dataset – large-scale clinical and radiomic data of head and neck cancer patients treated with radiotherapy

基本信息

模态
其他
大小
0.001558963 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-31
版本
v2

资源简介

HNC-PREDICTOR数据集:头颈癌放疗患者大规模临床与影像组学数据

HNC-PREDICTOR dataset – large-scale clinical and radiomic data of head and neck cancer patients treated with radiotherapy

该数据集来自figshare,包含3027例在MD Anderson Cancer Center接受根治性放疗的头颈癌患者的临床变量,并提供影像生物标志物数据及建模脚本与模型文件。数据可用于头颈癌放疗后的结局预测研究,支持基于机器学习的预测工具开发与验证,涵盖临床与影像组学多模态信息(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Head and neck cancer predictive risk estimator to determine control and therapeutic outcomes of radiotherapy (HNC-PREDICTOR): development, international multi-institutional validation, and web implementation of clinic-ready model-based risk stratification for head and neck cancer》发表于 European Journal of Cancer(2023),DOI:10.1016/j.ejca.2022.10.011。项目资助方:Rubicon fellowship, Netherlands Organisation for Scientific research and Wellcome trust grant (for Roots)。源站首次发布:2023-05-19。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据包含3027例在MD Anderson Cancer Center接受根治性放疗的头颈癌患者的临床变量。

【数据结构与技术规格】

文件数 3 个,合计 1.56 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.21303000.v2。

【主题与分类】

源站学科分类:Radiation therapy。主题标签:radiotherapy、Radiomics、outcome prediction tools、head and neck cancers、machine learning-based、Radiation Therapy。本站分类:肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Radiation therapy。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/HNC-PREDICTOR_dataset_large-scale_clinical_and_radiomic_data_of_head_and_neck_cancer_patients_treated_with_radiotherapy/21303000

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:van Dijk, Lisanne; Fuller, Clifton (Dave); Mohamed, Abdallah; Ahmed, Sara; Wahid, Kareem (2023). HNC-PREDICTOR dataset – large-scale clinical and radiomic data of head and neck cancer patients treated with radiotherapy. figshare. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Clinical_data_HNCPREDICTOR_MDACC.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/40692812"
curl -L -o "Image_biomarkers_MDA.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/40693733"
curl -L -o "FINAL_script&models_for_publication.zip" "https://ndownloader.figshare.com/files/40703207"

文件清单

  • Clinical_data_HNCPREDICTOR_MDACC.xlsx(548.72 KB)
  • Image_biomarkers_MDA.xlsx(749.04 KB)
  • FINAL_script&models_for_publication.zip(261.20 KB)

文件总体积 1.56 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

该数据包含3027例头颈癌患者的临床变量,这些患者在MD安德森癌症中心接受了根治性放疗。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.21303000.v2(source: https://figshare.com/articles/dataset/HNC-PREDICTOR_dataset_large-scale_clinical_and_radiomic_data_of_head_and_neck_cancer_patients_treated_with_radiotherapy/21303000)。

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