合成长肽喂养人树突状细胞的HLA-I免疫肽组分析用于治疗性疫苗设计

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD051490

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

合成长肽（SLPs）是一种有前景的疫苗模式，利用树突状细胞（DC）治疗慢性感染或癌症。目前，SLP的设计依赖于计算机预测和多因素T细胞试验来确定哪些SLP在DC人类白细胞抗原I类（HLA-I）上交叉呈递效果最佳。此外，基于TLR配体的佐剂如何影响DC交叉呈递尚不清楚。在此，我们生成了一个独特的高质量免疫肽组数据集，该数据集来自人类DC，这些DC被12种基于乙型肝炎病毒（HBV）的SLP脉冲处理，并分别与TLR1/2（Amplivant®）或TLR3（PolyI:C）配体结合。所获得的免疫肽组反映了佐剂诱导的差异，但SLP的交叉呈递没有差异。我们发现了在B等位基因上的主导性（交叉）呈递，并鉴定了33种独特的SLP衍生HLA-I肽，其中一些未被计算机预测，还有一些在所有供体中一致发现。我们的工作提出DC免疫肽组学作为治疗性疫苗设计的有价值工具。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。