食管鳞状细胞癌低琥珀酰化修饰组学数据集
该数据集来自 omicsdi.org,聚焦食管鳞状细胞癌中异常代谢导致的低琥珀酰化现象,包含蛋白质组与翻译后修饰相关数据

基本信息
资源简介
食管鳞状细胞癌低琥珀酰化修饰组学数据集
该数据集聚焦食管鳞状细胞癌中异常代谢所导致的低琥珀酰化现象,围绕蛋白质组与翻译后修饰(PTM)相关数据展开,英文名称为“Histone PTMs dataset for Hyposuccinylation Derived from Abnormal Metabolism Promotes the Cell Migration of Esophageal Squamous Cell Cancer”。研究识别出异常的蛋白质与翻译后修饰通路,其中包括癌细胞中许多下调的赖氨酸琥珀酰化位点;围绕低琥珀酰化这一改变,研究进一步揭示该修饰富集于代谢通路相关酶上,而琥珀酰辅酶A的减少可能导致这一现象。数据集主题标签为蛋白质组学(Proteomics),在站内归入肿瘤/其他分类,来源于 omicsdi.org。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
食管鳞状细胞癌是消化系统常见的恶性肿瘤之一,肿瘤细胞在发生与进展过程中常伴随代谢重编程。蛋白质翻译后修饰是连接代谢状态与细胞行为的重要环节,其中赖氨酸琥珀酰化作为一种与代谢中间产物密切相关的修饰类型,近年来受到关注。该数据集所对应的研究正是从这一角度切入,识别癌细胞中异常的蛋白质与翻译后修饰通路,并观察到许多赖氨酸琥珀酰化位点在癌细胞中呈下调状态。研究聚焦于低琥珀酰化这一改变,发现该修饰富集于代谢通路的酶类上,并提示琥珀酰辅酶A的减少可能是导致低琥珀酰化现象的原因,从而将异常代谢与翻译后修饰改变联系起来,为理解食管鳞状细胞癌的细胞迁移行为提供了修饰层面的线索。
【数据内容】
该数据集包含蛋白质组与翻译后修饰相关数据,主题标签为蛋白质组学。研究内容涉及对异常蛋白质与翻译后修饰通路的识别,并具体涉及癌细胞中许多下调的赖氨酸琥珀酰化位点。围绕低琥珀酰化,数据所支撑的分析指向该修饰在代谢通路酶类上的富集,以及琥珀酰辅酶A减少与这一现象之间的可能关联。关于数据的具体样本数量、位点数目、定量方法、文件格式与数据规模等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org,英文名称为“Histone PTMs dataset for Hyposuccinylation Derived from Abnormal Metabolism Promotes the Cell Migration of Esophageal Squamous Cell Cancer”,在站内分类中归入肿瘤/其他。关于样本采集的具体来源、实验平台、仪器型号、实验流程与数据处理步骤等信息,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题与内容,该数据集可用于围绕食管鳞状细胞癌中蛋白质翻译后修饰,特别是赖氨酸琥珀酰化改变的分析与探索;也可用于关注异常代谢与翻译后修饰通路之间关联的研究场景,例如代谢通路相关酶的修饰富集分析,以及琥珀酰辅酶A水平变化与低琥珀酰化现象关系的讨论。此外,该数据集可为蛋白质组学方向中翻译后修饰数据的比较与整合研究提供参考。关于具体的适用分析类型与验证用途,源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过 omicsdi.org 获取,主题标签为蛋白质组学。关于数据的具体下载方式、文件组织方式、预处理要求、分析流程与配套工具等信息,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集所对应的研究识别了异常蛋白质与翻译后修饰通路,并报告了癌细胞中许多下调的赖氨酸琥珀酰化位点,同时提出琥珀酰辅酶A减少可能导致低琥珀酰化现象。关于数据的完整性、覆盖度、定量精度、重复性以及样本规模等方面的评估信息,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与使用许可信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/iprox/PXD021700
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们识别出异常蛋白质及翻译后修饰(PTM)通路,其中包括癌细胞中许多下调的赖氨酸琥珀酰化位点。聚焦于低琥珀酰化现象,我们发现这种改变的PTM在代谢通路的酶上富集,而琥珀酰辅酶A的减少可能是导致这一现象的原因。
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