胰腺癌致癌KRAS反应主调控因子数据集
该数据集来自 NCBI GEO（GSE89846），围绕胰腺癌中致癌 KRAS 反应的主调控因子展开。研究利用携带可诱导 Lox-Stop-Lox（LSL）盒的 KF508 小鼠胰腺导管细胞系，在 KRASG12D 致癌基因诱导前后获取转录组表达谱，用于比较诱导后的差异表达情况
基本信息
资源简介
胰腺癌致癌KRAS反应主调控因子数据集
Master Regulators of oncogenic KRAS response in Pancreatic Cancer
该数据集来自 NCBI GEO（GSE89846），围绕胰腺癌中致癌 KRAS 反应的主调控因子展开。研究利用携带可诱导 Lox-Stop-Lox（LSL）盒的 KF508 小鼠胰腺导管细胞系，在 KRASG12D 致癌基因诱导前后获取转录组表达谱，用于比较诱导后的差异表达情况。数据以芯片表达谱形式提供，含 1 个文件（GSE89846_series_matrix.txt.gz），物种为小鼠（10090），平台为 GPL17543。可用于研究 KRAS 诱导相关转录变化及筛选潜在主调控因子（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Nov 15 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们利用 KF508 小鼠胰腺导管细胞系构建了致癌 KRAS 的转录特征，该细胞系在 KRASG12D 致癌基因前带有可诱导的 Lox-Stop-Lox（LSL）盒，用以调控转录。该数据集使我们能够研究小鼠中致癌 KRAS 诱导后的差异表达谱。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL17543、10090。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE89846
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 24 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE89846
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们利用KF508小鼠胰腺导管细胞系，该细胞系在致癌基因KRASG12D前带有可诱导的Lox-Stop-Lox (LSL) 盒以调控转录，从而推导出致癌KRAS的转录特征。此数据集使我们能够研究小鼠中致癌KRAS诱导后的差异表达谱。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
