散发性和FAP相关硬纤维瘤中的microRNA表达及其与β-catenin基因突变的相关性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE89687

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

硬纤维瘤（DT）是一种罕见的良性成纤维细胞肿瘤，组织学诊断具有挑战性。DT可散发，也可与家族性腺瘤性息肉病（FAP）相关。大多数散发性DT与β-catenin基因（CTNNB1）突变相关，而APC基因突变则导致FAP疾病。微小RNA（miRNA）参与许多人类癌变过程。通过微阵列分析了12例患者（8例散发性，4例FAP相关）和4例健康对照者的福尔马林固定、石蜡包埋（FFEP）标本中的miRNA谱。共有101个miRNA发生失调，其中散发性DT中98个，FAP相关DT中8个，5个为两种肿瘤共有。随后在23例散发性DT和7例FAP相关DT样本（与健康对照匹配）中通过RT-qPCR验证了26个miRNA。采用相同的qPCR方法评估散发性DT中CTNNB1的突变状态。散发性DT与miRNA表达的相关性显示，miR-21-3p在突变型DT中较野生型升高，而miR-197-3p则降低。

还评估了Tetraspanin3和Serpin家族A成员3（miR-21-3p的靶点）以及L1细胞黏附分子（miR-197-3p的靶点）的mRNA表达。与miRNA失调相关的CTNNB1突变有助于散发性DTs的组织学诊断，并可能影响该疾病的发生和进展。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。