JAK2+骨髓增殖性肿瘤患者来源人骨髓间充质干细胞的基因表达谱

该数据集来自 NCBI GEO,包含 JAK2V617F 突变骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者与健康供者骨髓间充质干细胞(BM-MSC)的基因表达谱比较,并涉及 MSC 细胞系与 UKE-1 MPN 细胞系共培养后造血支持相关基因的 RT-PCR 检测

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL169879606
GSE87806: Gene expression profiles of human Mesenchymal Stromal Cells (MSC) from JAK2+ myeloproliferative neoplasms (MPN)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-30

资源简介

JAK2+骨髓增殖性肿瘤患者来源人骨髓间充质干细胞的基因表达谱

Gene expression profiles of human Mesenchymal Stromal Cells (MSC) from JAK2+ myeloproliferative neoplasms (MPN)

该数据集来自 NCBI GEO,包含 JAK2V617F 突变骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者与健康供者骨髓间充质干细胞(BM-MSC)的基因表达谱比较,并涉及 MSC 细胞系与 UKE-1 MPN 细胞系共培养后造血支持相关基因的 RT-PCR 检测。数据可用于分析 MPN 患者 BM-MSC 的生物学功能与表达谱改变,以及白血病细胞对 MSC 造血支持基因的调控作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 11 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在本研究中,我们分析了携带 JAK2V617F 突变的 MPN 患者骨髓间充质干细胞(BM-MSC)的行为。我们首先表征了 MPN 患者 BM-MSC 与健康供者(HD)BM-MSC 相比的生物学功能和基因表达谱变化。随后,我们建立了 MSC 细胞系(HTERT 和 HS5)与 UKE-1 MPN 细胞系的共培养,并进行 RT-PCR 以研究白血病细胞是否能够改变与造血支持相关的基因。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL16987、9606。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE87806

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 14 201,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中,我们分析了携带JAK2V617F突变的MPN患者骨髓间充质干细胞(BM-MSC)的行为。我们首先对MPN患者BM-MSC与健康供者(HD)BM-MSC的生物学功能和基因表达谱变化进行了表征。随后,我们建立了MSC细胞系(HTERT和HS5)与UKE-1 MPN细胞系的共培养体系,并采用RT-PCR技术研究白血病细胞是否能够改变与造血支持相关的基因。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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