GSE85271:KANK1通过调控CXXC5诱导凋亡抑制人恶性外周神经鞘瘤细胞生长
该数据集来自NCBI GEO,包含人恶性外周神经鞘瘤(MPNST)稳定细胞系在未处理与Doxycycline处理条件下的mRNA测序数据,共6个样本,其中3个为未处理对照、3个为1 ug/ml Doxycycline处理,使用Illumina Hiseq 2500平台测序

基本信息
资源简介
GSE85271:KANK1通过调控CXXC5诱导凋亡抑制人恶性外周神经鞘瘤细胞生长
KANK1 inhibits cell growth by inducing apoptosis though regulating CXXC5 in human malignant peripheral nerve sheath tumors
该数据集来自NCBI GEO,包含人恶性外周神经鞘瘤(MPNST)稳定细胞系在未处理与Doxycycline处理条件下的mRNA测序数据,共6个样本,其中3个为未处理对照、3个为1 ug/ml Doxycycline处理,使用Illumina Hiseq 2500平台测序。数据可用于比较处理前后基因表达差异,研究KANK1通过调控CXXC5诱导凋亡抑制MPNST细胞生长的表达谱特征(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 06 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究的目的是识别未处理与Doxycycline处理的人恶性外周神经鞘瘤(MPNST)细胞系之间的表达差异。我们对6个慢病毒感染的MPNST人稳定细胞系(STS26T-pLIX405-KANK1)的mRNA进行了测序,使用Illumina Hiseq 2500测序平台。三个对照样本为未处理的稳定细胞,三个样本为Doxycycline处理(1 ug/ml)。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL16791、9606。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE85271
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 15 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE85271
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究的目的是识别未处理与多西环素处理的人恶性外周神经鞘瘤(MPNST)细胞系之间的表达差异。我们对6株慢病毒感染的MPNST人稳定细胞系(STS26T-pLIX405-KANK1)的mRNA进行了测序,使用Illumina Hiseq 2500测序平台。三个对照样本为未处理的稳定细胞,三个样本为多西环素处理(1 μg/ml)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




