GSE76352：识别结直肠癌疾病相关基因的新型3D培养系统[外显子组测序]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE76352

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

越来越多的人认识到，培养的上皮细胞在二维与三维环境中的特性存在显著差异，而后者更能忠实再现体内行为。通过在1型胶原中研究一系列人结直肠癌（CRC）细胞系，我们发现HCA-7细胞形成的集落具有两种独特且持续存在的形态学和功能特性。我们主要观察到单层极化的囊状结构（囊性集落，CC），以及较小部分呈现高度侵袭性的无序实性团块（刺状集落，SC）。尽管整体基因组相似，CC和SC在三维环境中表现出不同且动态的基因表达模式。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。