DCIS.COM与SUM225 MIND异种移植瘤2至6至10周转变期基因表达
该数据集来自NCBI GEO,收录DCIS.COM与SUM225两种细胞系构建的小鼠导管内(MIND)异种移植模型在2周、6周、10周时间点的基因表达谱,使用GPL570芯片平台,物种为9606

基本信息
资源简介
DCIS.COM与SUM225 MIND异种移植瘤2至6至10周转变期基因表达
Gene expression in DCIS.COM and SUM225 MIND xenografts during transition from 2 to 6 to 10 weeks
该数据集来自NCBI GEO,收录DCIS.COM与SUM225两种细胞系构建的小鼠导管内(MIND)异种移植模型在2周、6周、10周时间点的基因表达谱,使用GPL570芯片平台,物种为9606。数据可用于刻画导管原位癌向浸润癌演进过程中上皮细胞mRNA表达的时序变化,支持差异表达分析与进展相关基因筛选(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 12 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们利用DCIS小鼠导管内(MIND)模型,结合SUM225和DCIS.COM细胞系,以表征在体内从DCIS向浸润癌进展过程中,上皮细胞在2、6和10周时间进程内mRNA表达的连续性和时间性变化。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL570、9606。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE65890
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 25 201,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们利用DCIS小鼠导管内(MIND)模型,采用SUM225和DCIS.COM两种细胞系,以表征在体内从DCIS进展为浸润性癌的过程中,上皮细胞在2、6和10周时间进程内mRNA表达的序贯性和时间性变化。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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