管家基因分析——类癌与正常黏膜
该数据集来自 NCBI GEO，标题为管家基因分析——类癌与正常黏膜，属于肿瘤/其他分类。数据基于 GeneChip（Affymetrix U133A）平台，包含 36 例胃肠道肿瘤与正常组织的表达谱，用于筛选高表达且变异低的候选内参基因，并在独立的 42 例胃肠道组织样本中通过实时 RT-PCR
基本信息
资源简介
管家基因分析——类癌与正常黏膜
House keeping gene analysis - carcinoids and normal mucosa
该数据集来自 NCBI GEO，标题为管家基因分析——类癌与正常黏膜，属于肿瘤/其他分类。数据基于 GeneChip（Affymetrix U133A）平台，包含 36 例胃肠道肿瘤与正常组织的表达谱，用于筛选高表达且变异低的候选内参基因，并在独立的 42 例胃肠道组织样本中通过实时 RT-PCR 验证表达水平。该数据可用于研究肿瘤与正常黏膜间的基因表达差异，以及评估管家基因作为定量归一化内参的稳定性（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Nov 13 200。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：目标基因的准确定量和可重复定量取决于正确的归一化。历史上，具有组织转录变异的基因（例如 GAPDH）曾被用作归一化因子，这存在问题，尤其是在通常来源于不同组织来源的临床样本中。使用大规模基因数据库（36 例胃肠道肿瘤和正常组织的 GeneChip（Affymetrix U133A）数据集），我们鉴定出 8 个高表达且变异低的候选内参基因，并在独立的胃肠道组织样本集（n=42）中通过实时 RT-PCR 确定了表达水平。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL96、9606。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE6272
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 10 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE6272
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
目标基因的准确定量和可重复性取决于正确的归一化。历史上，具有组织转录变异的基因，如GAPDH，曾被用作归一化因子，但这存在问题，特别是在临床样本中，这些样本往往来源于不同的组织类型。利用大规模基因数据库（Affymetrix U133A基因芯片数据集，包含36个胃肠肿瘤和正常组织），我们鉴定了8个高表达且变异度低的候选参考基因，并通过实时RT-PCR在一组独立的胃肠道组织样本（n=42）中确定了其表达水平。关键词：管家基因，肠道，类癌
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
