腺病毒小E1A利用赖氨酸乙酰转移酶p300/CBP与抑癌因子Rb抑制宿主基因并促进有效病毒感染[RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE59688

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

腺病毒小e1a的致癌转化依赖于其与宿主赖氨酸乙酰化酶p300/CBP及肿瘤抑制因子RB的同时相互作用。这些相互作用如何影响细胞基因表达尚不清楚。我们发现，e1a将RB从E2F转录因子上置换下来，并促进p300对RB1 K873/K874的乙酰化，将其锁定为一种抑制性构象，该构象与抑制性染色质修饰酶相互作用。这些抑制性p300-e1a-RB1复合物特异性作用于基因体内具有异常高p300结合的宿主基因。TGF-β、TNF和白细胞介素信号通路组分在这类p300靶向基因中富集。p300-e1a-RB1复合物以依赖于HDAC活性、p300赖氨酸乙酰化酶活性、p300溴结构域以及RB K873/K874和e1a K239乙酰化的方式凝聚染色质，从而抑制那些原本会阻碍有效病毒感染宿主基因。因此，腺病毒利用e1a抑制干扰病毒复制的宿主基因。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。