年轻囊性纤维化患者铜绿假单胞菌lasR突变体

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE5560

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数据说明

铜绿假单胞菌在囊性纤维化(CF)患者气道的慢性感染过程中会发生遗传改变。一种常见的变化是lasR的突变。LasR是一种转录调节因子，它响应铜绿假单胞菌中的一种群体感应信号，并调节急性毒力因子的表达以及中枢代谢功能。lasR失活的铜绿假单胞菌突变体在CF患者气道慢性感染早期出现，并且在实验室Luria-Bertani琼脂上生长期间也会出现。这两种环境都富含氨基酸。在这些分离株中lasR的失活赋予了利用氨基酸的生长优势，这一表型可以解释lasR突变体在体内和体外的选择。铜绿假单胞菌lasR突变体通过其独特的菌落形态被鉴定出来，包括与4-羟基-2-烷基喹啉(HAQs)失衡相关的自溶现象，以及可能由一种此类HAQ积累引起的虹彩金属光泽。由于lasR失活导致的转录谱改变在来自多名年轻CF患者的分离株中是保守的。P。

铜绿假单胞菌lasR突变可能代表替代标记物，用以描绘CF气道疾病自然史的不同阶段，每个阶段具有不同的预后和治疗意义，类似于指导癌症治疗的标记物。与促进无限制生长的癌细胞突变相似，lasR突变可能通过更有效地利用可用氨基酸，促进CF气道中铜绿假单胞菌的无限制生长。关键词：疾病状态分析

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。