Ly1 DLBCL与结肠癌转录组分ChIP-Seq数据集
研究利用ChIP-Seq在全基因组范围定位蛋白结合位点，探究靶向CDK9和BRD4等DNA相关过程的小分子治疗药物的功能
基本信息
资源简介
Ly1 DLBCL与结肠癌转录组分ChIP-Seq数据集
ChIP-Seq of Transcriptional Components in Ly1 DLBCL and Colon carcinoma
该数据集为GSE53601，来源于NCBI GEO，包含Ly1 DLBCL与结肠癌中转录组分的ChIP-Seq数据，共1个文件（GSE53601_series_matrix.txt.gz）。研究利用ChIP-Seq在全基因组范围定位蛋白结合位点，探究靶向CDK9和BRD4等DNA相关过程的小分子治疗药物的功能。数据可用于分析转录因子和染色质调控因子在肿瘤细胞中的基因组占据情况，支持肿瘤表观遗传与转录调控研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Dec 23 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：利用ChIP-Seq发现蛋白质在全基因组范围内的位置，使得人们能够全局性绘制控制多种细胞基因表达程序的关键转录因子和染色质调控因子图谱。许多DNA相关过程是疾病治疗的靶点。本研究探讨靶向与CDK9和BRD4相关的DNA相关过程的小分子治疗药物的功能。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL11154、9606。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE53601
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 15 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE53601
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
利用ChIP-Seq技术发现蛋白质在全基因组范围内的定位，使得我们能够全局性地绘制出控制不同细胞基因表达程序的关键转录因子和染色质调节因子的图谱。许多与DNA相关的过程是疾病治疗的靶点。本研究探讨了针对涉及CDK9和BRD4的DNA相关过程的小分子疗法的功能。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
