RNA-seq分析Ewing肉瘤细胞中EWS-FLI1融合蛋白下调效应

该数据集来自NCBI GEO,包含A673 Ewing肉瘤细胞系中稳定表达靶向EWS-FLI1融合蛋白或荧光素酶对照的shRNA的RNA-seq数据,用于研究EWS-FLI1对转录组的影响

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基因组预测GPL111549606
GSE53066: Anaylsis of the effect of down-regulation of the EWS-FLI1 fusion protein in Ewing Sarcoma cells by RNA-seq.

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-30

资源简介

RNA-seq分析Ewing肉瘤细胞中EWS-FLI1融合蛋白下调效应

Anaylsis of the effect of down-regulation of the EWS-FLI1 fusion protein in Ewing Sarcoma cells by RNA-seq.

该数据集来自NCBI GEO,包含A673 Ewing肉瘤细胞系中稳定表达靶向EWS-FLI1融合蛋白或荧光素酶对照的shRNA的RNA-seq数据,用于研究EWS-FLI1对转录组的影响。数据覆盖表达谱分析,可用于差异表达分析、融合蛋白调控靶基因的预测与验证,以及Ewing肉瘤分子机制研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 06 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们生成了稳定表达靶向EWS-FLI1融合蛋白或荧光素酶对照的shRNA的A673 Ewing肉瘤细胞系,以研究EWS-FLI1对转录组的影响。用于生成细胞系的载体是Stephen Lessnick的赠礼,并首次发表于PMID 16697960。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL11154、9606。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE53066

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 15 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们构建了稳定表达靶向EWS-FLI1融合蛋白的shRNA或作为对照的荧光素酶的A673尤文肉瘤细胞系,以研究EWS-FLI1对转录组的影响。用于构建这些细胞系的载体由Stephen Lessnick惠赠,并首次发表于PMID 16697960。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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