突变IDH2诱导肉瘤数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE50539

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

超过50%的软骨肉瘤患者存在异柠檬酸脱氢酶1（IDH1）或IDH2的功能获得性突变。在本研究中，我们对软骨肉瘤活检样本进行了全基因组CpG甲基化测序，发现IDH突变与CpG岛上的DNA高甲基化相关，但与其他基因组区域无关。CpG岛高甲基化区域富集了与干细胞维持/分化和谱系特化相关的基因。在小鼠10T1/2间充质20祖细胞中，突变型IDH2的表达导致DNA高甲基化和分化受损，而使用DNA去甲基化剂治疗可逆转这一现象。突变型IDH2的引入还诱导了接触抑制的丧失，并在体内产生了未分化肉瘤。突变型IDH2的致癌潜力与其产生2-羟基戊二酸的能力相关。综上所述，这些数据表明新形态IDH2突变在间充质细胞中具有致癌性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。