小鼠上皮细胞自发转化中的非整倍体、癌基因扩增与上皮间质转化 [CGH]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE45128

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

人类上皮性癌症的特征是特定染色体非整倍体的反复分布。在我们的模型系统中，小鼠膀胱和肾上皮细胞经过长期培养后自发永生化、转化并具有致瘤性。我们评估了基因组和转录组的变化，发现了广泛存在的非整倍体、早期转录失调以及细胞转录组的大规模基因组失调。研究结果揭示了与人类肿瘤发生过程中检测到的基因组和转录组异常有着显著的相似性，从而验证了我们新建立的癌症模型。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。