使用Smoothened抑制剂IPI-926抑制软骨肉瘤Hedgehog通路直接抑制肉瘤细胞生长
数据覆盖携带原代人软骨肉瘤异种移植瘤的小鼠,经IPI-926处理后测量已知Hh通路基因的mRNA水平及终点肿瘤体积。可用于分析Hedgehog通路基因表达变化与肿瘤体积的关联,以及评估IPI-926对软骨肉瘤的抑制作用(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
使用Smoothened抑制剂IPI-926抑制软骨肉瘤Hedgehog通路直接抑制肉瘤细胞生长
Hedgehog pathway inhibition in chondrosarcoma using the Smoothened inhibitor IPI-926 directly inhibits sarcoma cell growth
该数据集来自NCBI GEO(GSE44581),研究使用Smoothened抑制剂IPI-926抑制软骨肉瘤中的Hedgehog通路。数据覆盖携带原代人软骨肉瘤异种移植瘤的小鼠,经IPI-926处理后测量已知Hh通路基因的mRNA水平及终点肿瘤体积。数据集包含1个文件(GSE44581_series_matrix.txt.gz),基于GPL6480表达谱芯片平台,物种为人(9606)。可用于分析Hedgehog通路基因表达变化与肿瘤体积的关联,以及评估IPI-926对软骨肉瘤的抑制作用(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 22 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):携带原代人软骨肉瘤异种移植瘤的小鼠接受IPI 926处理,测量已知Hh通路基因的mRNA水平和终点肿瘤体积。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL6480、9606。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE44581
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 23 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
携带原发性人类软骨肉瘤异种移植瘤的小鼠接受IPI 926治疗,并测量了已知Hh通路基因的mRNA水平和终点肿瘤体积。对IPI-926治疗的肿瘤进行基因表达谱分析,以识别潜在的新Hh靶基因。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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