MEK抑制剂在人类和小鼠神经纤维瘤中显示疗效,尽管存在对ERK的转录反馈
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE41747_series_matrix.txt.gz),主题为表达谱芯片分析,物种涉及人类(9606)与小鼠神经纤维瘤及恶性外周神经鞘瘤(MPNST)

基本信息
资源简介
MEK抑制剂在人类和小鼠神经纤维瘤中显示疗效,尽管存在对ERK的转录反馈
MEK inhibition exhibits efficacy in human and mouse neurofibromatosis tumors, despite transcriptional feedback onto ERK.
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE41747_series_matrix.txt.gz),主题为表达谱芯片分析,物种涉及人类(9606)与小鼠神经纤维瘤及恶性外周神经鞘瘤(MPNST)。数据用于跨物种转录组分析,识别Ras-Raf-MEK-ERK信号通路的全局负反馈基因,并评估MEK抑制剂PD0325901对持续ERK激活的神经纤维瘤生长的影响。可用于研究NF1肿瘤的分子机制及MEK靶向治疗反应(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Oct 22 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):1型神经纤维瘤病(NF1)患者会发展出良性神经纤维瘤和恶性外周神经鞘瘤(MPNST)。这些无法治愈的外周神经肿瘤源于NF1抑癌基因功能缺失,导致Ras信号过度活跃。激活的Ras控制众多下游效应器,但介导NF1肿瘤中过度活跃Ras效应的具体通路尚不清楚。对小鼠和人类神经纤维瘤及MPNST的跨物种转录组分析发现,两个物种中调控Ras-Raf-MEK-细胞外信号调节蛋白激酶(ERK)信号的基因存在全局负反馈。尽管如此,小鼠和人类神经纤维瘤及MPNST中ERK的激活仍持续存在。PD0325901是一种高选择性MEK药理学抑制剂,用于测试持续的Ras-Raf-MEK-ERK信号是否促进Nf1fl/fl;Dhh-cre小鼠神经纤维瘤的生长。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL10371、9606。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE41747
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 28 201,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
1型神经纤维瘤病(NF1)患者会发展出良性神经纤维瘤和恶性外周神经鞘瘤(MPNST)。这些无法治愈的外周神经肿瘤源于NF1抑癌基因功能丧失,导致Ras信号过度活跃。活化的Ras调控众多下游效应器,但介导NF1肿瘤中过度活跃Ras效应的具体途径尚不清楚。对小鼠和人类神经纤维瘤及MPNST的跨物种转录组分析发现,两种物种中调控Ras-Raf-MEK-细胞外信号调节蛋白激酶(ERK)信号的基因均存在全局性负反馈。尽管如此,小鼠和人类神经纤维瘤及MPNST中ERK的激活仍持续存在。使用高度选择性的MEK药理学抑制剂PD0325901,测试了持续的Ras-Raf-MEK-ERK信号是否促进Nf1fl/fl;Dhh-cre小鼠模型中的神经纤维瘤生长或NF1患者MPNST细胞异种移植瘤的生长。PD0325901治疗减少了神经纤维瘤和MPNST中异常增殖的细胞,延长了植入人类MPNST细胞的小鼠的生存期,并使超过80%的受试小鼠的神经纤维瘤缩小。PD0325901还对肿瘤血管系统产生了影响。
我们的数据表明,失调的Ras/ERK信号传导对于NF1外周神经肿瘤的生长至关重要,并为在NF1临床试验中测试MEK抑制剂提供了强有力的依据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




