配对乳腺导管原位癌与浸润性肿瘤基因表达谱
该数据集为九例乳腺导管癌患者的配对样本分析，同时包含导管原位癌（DCIS）与浸润性成分（IDC）的基因表达谱数据，采用芯片表达谱技术，平台为GPL96，物种为9606（人）
基本信息
资源简介
配对乳腺导管原位癌与浸润性肿瘤基因表达谱
GSE3893 是一个针对乳腺导管癌的基因表达谱数据集，围绕同一患者体内导管原位癌（DCIS）与浸润性成分（IDC）的配对比较展开。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，收录了九例乳腺导管癌患者的配对样本表达数据，采用芯片表达谱技术，平台为 GPL96，物种为人（9606）。数据集英文名称为“Gene Expression Profiling of matched Ductal Carcinomas in Situ and Invasive Breast Tumors”，本站归类为肿瘤 / 其他，共包含 1 个数据文件，样例文件为 GSE3893_series_matrix.txt.gz，作者为 Christina S. Schütz，发布时间为 Dec 22 200。整体而言，该数据集适合用于观察 DCIS 向 IDC 转变过程中的基因表达差异。
【数据集背景】
该数据集的研究背景是乳腺导管癌从导管原位癌（DCIS）向浸润性导管癌（IDC）过渡的分子机制。源站描述指出，这是一项针对九例乳腺导管癌的配对分析，同时考察 DCIS 与浸润性成分（IDC），目的在于识别能够表征 DCIS 向 IDC 转变过程的新分子标志物，从而更好地理解其分子生物学特征。配对设计使得同一患者的原位癌与浸润性成分可以在相对一致的遗传背景下进行比较，有助于聚焦转变过程本身的表达变化。
【数据内容】
数据集包含九例乳腺导管癌患者的配对样本基因表达谱数据，每例同时涵盖导管原位癌（DCIS）与浸润性成分（IDC）。数据以芯片表达谱形式呈现，平台为 GPL96，物种为人（9606）。数据集文件数量为 1，样例文件名为 GSE3893_series_matrix.txt.gz，采用 GZIP 压缩格式。主题标签包括 Expression profiling by array、GPL96 和 9606，分别对应表达谱芯片技术、芯片平台与人类物种。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题与数据集英文名称一致，均为“Gene Expression Profiling of matched Ductal Carcinomas in Situ and Invasive Breast Tumors”。作者为 Christina S. Schütz，发布时间为 Dec 22 200。样本采集的具体机构、伦理审批信息以及实验处理细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究乳腺导管癌从原位向浸润性转变的分子特征，例如比较配对 DCIS 与 IDC 样本之间的基因表达差异、寻找与转变过程相关的候选分子标志物，以及围绕 GPL96 平台开展表达谱数据的再分析。由于采用配对设计，也适合用于需要控制个体间差异的比较研究。其他具体应用方向源站未提供。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE3893_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。关于芯片数据预处理、归一化及统计分析的详细步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于九例患者的配对样本，样本量相对有限，结论的外推需谨慎。数据仅包含 1 个文件，未提供其他辅助文件或重复实验信息。关于数据质控指标、缺失值情况以及批次效应等信息，源站未提供。
【引用与许可】
引用该数据集时，应参考源站 ncbi.nlm.nih.gov 上的原始记录，作者为 Christina S. Schütz。关于数据使用许可与再分发条件，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE3893
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
这是一项对九例乳腺导管癌的原位导管癌(DCIS)和浸润成分(IDC)进行的配对分析，旨在识别表征从DCIS向IDC转变的新分子标志物，以更好地理解其分子生物学。关键词：基于Affymetrix的乳腺微阵列
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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