流感H3N2/HK/1/68-MA20宿主易感性性别依赖效应的临床与表达QTL定位

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE35888

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

季节性流感暴发和反复出现的流感大流行对公共卫生构成重大挑战。通过研究不同宿主物种对流感病毒的免疫应答，有可能发现不同流感毒株感染所致易感性的共同机制。这可能带来具有广泛临床应用前景的新型治疗靶点。我们利用一株小鼠适应株流感病毒（A/HK/1/68-MA20 [H3N2]），建立了一种重症流感（p-flu）小鼠模型，该模型再现了与人类p-flu易感性相关的标志性高病毒载量和细胞因子过度表达。我们利用一组29个密切相关的近交系小鼠（由流感易感的A/J小鼠和流感抵抗的C57BL/6J（B6）小鼠培育而成的AcB/BcA重组同类系小鼠品系组），绘制了宿主应答的遗传决定因素。结合临床数量性状位点（cQTL）和肺表达QTL（eQTL）定位，我们鉴定出2号和17号染色体上两个性别特异性QTL的候选基因。前者包括先前描述的Hc基因，该基因缺陷与雌性易感表型相关。

后者包括磷脂酶基因Pla2g7和Tnfrsf21，后者是肿瘤坏死因子受体超家族的一员。确认17号染色体QTL下的基因可能揭示治疗流感的新策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。