ANKRD13A缺失介导的稳态检查点丧失导致结肠炎与结直肠癌双重易感性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE351125

标准获取流程：

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3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肠上皮面临持续微生物暴露与快速细胞更新的双重挑战；然而，维持其屏障以预防结肠炎和结直肠癌的机制仍不清楚。本研究发现，ANKRD13A在人溃疡性结肠炎（UC）、儿童UC、炎症黏膜及小鼠结肠炎模型中持续下调。对公开GWAS数据的补充分析显示，ANKRD13A的一个内含子变异与克罗恩病相关。Ankrd13a缺陷导致高剂量和持续低剂量DSS方案下均出现100%死亡率，而野生型小鼠分别有50%和80%存活。Ankrd13a缺陷小鼠表现出更严重的体重下降、结肠缩短、组织学损伤、杯状细胞耗竭及上皮通透性增加。在AOM/DSS模型中，Ankrd13a缺陷小鼠发生多灶性高级别异型增生和浸润性腺癌，单细胞转录组学揭示其组成向肿瘤性上皮状态转变。机制上，骨髓嵌合实验将ANKRD13A的保护功能定位至肠上皮，其中ZO-1连接缺陷在DSS暴露第1天即显现。

总体而言，这些发现确立了ANKRD13A在结肠炎和结直肠癌中是一个至关重要的基因，其缺失会削弱上皮屏障的韧性，易导致严重的炎症性损伤，并加速肿瘤进展。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。