GSE349766：重新定义Sudan类似物Scarlet808作为癌症多药耐药安全有效逆转剂

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE349766

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

多药耐药（MDR）由ATP结合盒（ABC）转运蛋白介导，是癌症化疗成功的主要障碍。MDR逆转剂的临床开发一直因固有的毒性而面临挑战。在此，我们报告发现Scarlet 808可作为ABC转运蛋白的有效且无毒拮抗剂。我们进行了RNA测序（RNA-seq），以评估Scarlet 808处理后MDR细胞中的转录组改变。使用RSEM（v1.3.1）对基因表达水平进行定量，并使用DESeq2（v1.42.0）分析差异表达。差异表达基因（DEGs）使用ggplot2（v3.4.4）进行可视化，并使用pheatmap包（v1.0.12）聚类为热图。通路富集分析，包括KEGG（京都基因与基因组百科全书）、GO（基因本体论）和Hallmark通路，使用clusterProfiler（v4.10.0）进行。所有分析均在R v4.3.1中进行。这些数据集支持相关手稿中描述的发现。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。