唾液酸通过细胞应激反应增强治疗性T细胞适应性:高渗与ROS清除30小时响应

该数据集来自 NCBI GEO,标题为唾液酸通过细胞应激反应增强治疗性T细胞适应性:高渗与ROS清除30小时响应。可用于分析高渗与 ROS 清除条件下 T 细胞的转录组变化(来源 NCBI)

geo
浏览 15
基因组回归GPL3429010090
GSE347038: Sialic acid augments therapeutic T cell fitness through cellular stress response: 30h response to hyperosmolarity and ROS scavenging [30 hr data]

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

唾液酸通过细胞应激反应增强治疗性T细胞适应性:高渗与ROS清除30小时响应

Sialic acid augments therapeutic T cell fitness through cellular stress response: 30h response to hyperosmolarity and ROS scavenging [30 hr data]

该数据集来自 NCBI GEO,标题为唾液酸通过细胞应激反应增强治疗性T细胞适应性:高渗与ROS清除30小时响应。数据包含1个文件 GSE347038_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序表达谱技术,物种为小鼠(10090),平台为 GPL34290。研究关注高渗肿瘤微环境下 T 细胞分化,涉及 N-acetylneuraminic acid (Neu5Ac) 对 T 细胞干性与增殖的调控,以及 NFAT5、ROS、AKT、FOXO1 等通路。可用于分析高渗与 ROS 清除条件下 T 细胞的转录组变化(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 11 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):高渗是肿瘤微环境的一个标志,导致严重的免疫抑制,但其对 T 细胞分化的影响仍未得到充分探索。通过系统性渗透压调节剂筛选,我们鉴定出 N-乙酰神经氨酸(Neu5Ac),即人体中最丰富的唾液酸形式,作为一种独特的渗透调节剂,既能保持 T 细胞干性又能促进增殖。机制上,Neu5Ac 激活张力响应转录因子 NFAT5 介导的渗透感应,同时清除活性氧(ROS)。这两条双重应激反应通路汇聚于 AKT 抑制,通过激活主分化调节因子 FOXO1 来保持 T 细胞干性。同时,降低的 ROS 水平改善氧化还原稳态和线粒体适应性,从而促进 T 细胞增殖。总之,这些发现揭示了一个 u

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34290、10090。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE347038

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 06 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE347038

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

高渗性是肿瘤微环境的一个标志性特征,有助于形成深度免疫抑制,但其对T细胞分化的影响仍未被充分探索。通过系统性渗透质筛选,我们鉴定出N-乙酰神经氨酸(Neu5Ac)——人体中含量最丰富的唾液酸形式——作为一种独特的渗透调节剂,能够同时维持T细胞干性并促进增殖。在机制上,Neu5Ac激活张力响应性转录因子NFAT5介导的渗透感应,同时清除活性氧(ROS)。这两条双重应激响应通路汇聚于AKT抑制,通过激活主分化调控因子FOXO1来维持T细胞干性。与此同时,ROS水平降低改善了氧化还原稳态和线粒体适应性,从而促进T细胞增殖。总之,这些发现揭示了渗透压和氧化应激在塑造T细胞命运中一个未被充分认识的作用,并确立了Neu5Ac补充作为一种简单、可转化的策略,用于生成具有优越功能质量的、治疗相关数量的T细胞。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。