GSE343826：CircATP5C1通过HNRNPR核输出及泛素化依赖性BCL2L1上调驱动甲状腺乳头状癌进展

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE343826

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数据说明

甲状腺乳头状癌（PTC）是最常见的内分泌恶性肿瘤，侵袭性PTC表型可导致患者预后不良。环状RNA（circRNA）是一类稳定的非编码RNA，在肿瘤进展中发挥关键作用，但其在PTC中的调控机制仍 largely 不清楚。本研究探讨了circATP5C1在PTC中的致癌作用及分子机制。我们采用聚合酶链反应（PCR）、荧光原位杂交（FISH）、RNA测序、RNA免疫沉淀（RIP）、免疫共沉淀（Co-IP）、蛋白质印迹以及CCK-8、集落形成和划痕愈合实验来探究circATP5C1的表达与功能。进一步采用皮下异种移植小鼠模型进行体内验证。CircATP5C1在PTC组织中显著上调，并与甲状腺外侵犯和淋巴结转移密切相关。功能实验证实，circATP5C1在体外促进PTC细胞增殖和迁移，并在体内促进肿瘤生长。机制上，circATP5C1直接结合异质核糖核蛋白R（HNRNPR），增强其泛素化和核输出。

细胞质中的HNRNPR进一步稳定BCL2L1 mRNA并上调其表达。使用泛素化抑制剂PYR-41处理可阻断HNRNPR的核输出，并逆转circATP5C1介导的致癌效应。总体而言，circATP5C1作为一种致癌性circRNA，通过调控依赖HNRNPR的BCL2L1 mRNA稳定性来驱动PTC进展，为PTC提供了新的诊断生物标志物和治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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