GSE342989：TBX2与TBX3在膀胱发育中控制尿路上皮分层与谱系稳定性的冗余功能

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE342989

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数据说明

背景 尿路上皮是一种特化的复层上皮，构成膀胱的渗透屏障，由基底细胞层、中间细胞层和浅表细胞层组成。尽管密切相关的T-box转录因子基因TBX2和TBX3与膀胱癌有关，但它们在正常尿路上皮发育中的功能仍不清楚。方法 我们使用RNA原位杂交和免疫荧光分析了小鼠膀胱发育过程中Tbx2/TBX2和Tbx3/TBX3的表达。通过小鼠条件性基因打靶研究了Tbx2和Tbx3在尿路上皮发育中的单独及联合功能。通过跨发育阶段的标志物分析和晚期胎儿膀胱的单核RNA测序评估了Tbx2/Tbx3缺失的细胞学后果。对分离的突变尿路上皮细胞进行转录组分析，以识别与Tbx2/Tbx3缺失相关的基因程序，并通过通路组分和靶标的表达谱分析来研究发育信号通路。结果 Tbx2/TBX2和Tbx3/TBX3在发育中的小鼠尿路上皮中持续共表达。

单独缺失任一基因对尿路上皮结构影响甚微，而联合缺失则破坏了分层，导致形成主要由浅表细胞样细胞组成的单层上皮。这些缺陷出现之前，ΔNP63（尿路上皮分层及基底/中间细胞分化的关键调控因子）表达降低、间充质基因程序激活，以及发育中上皮内BMP和TGFβ通路活性改变。结论：TBX2和TBX3是尿路上皮分层与分化的冗余发育调控因子。通过维持上皮身份并防止间充质程序的不当激活，这些因子建立了一个有助于理解膀胱疾病中上皮可塑性的发育框架。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。