GSE342390：脂滴中的胆固醇酯在G3/G4髓母细胞瘤细胞能量产生中的关键作用

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE342390

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数据说明

髓母细胞瘤是最常见的儿童恶性脑肿瘤。高危亚组，包括MYC驱动的第3组、第4组和侵袭性sonic hedgehog肿瘤，对当前疗法具有耐药性，且与较差的生存率相关。金标准治疗包括手术切除联合激进化疗和放疗，会导致严重的发育副作用，凸显了对新方法的需求。代谢重编程是癌症进展的关键组成部分，其中脂质代谢上调对于支持癌症在营养匮乏条件下的生存至关重要。脂滴是动态的细胞内细胞器，可防止脂毒性，但其在高危髓母细胞瘤亚组中的作用仍知之甚少。在此，我们利用一组髓母细胞瘤细胞的转录组学和脂质组学来理解脂质代谢的作用。我们的数据显示，高危髓母细胞瘤细胞的脂滴数量和PLIN2表达增加。这种PLIN2表达增加在人类组织微阵列分析中是一致的。

从机制上讲，这是由于从头脂肪生成、胆固醇生物合成和脂质摄取的增强所致。外源性递送各种脂质揭示了高风险细胞中脂滴成熟过程的改变。总之，高风险Group 3和Group 4髓母细胞瘤细胞利用脂滴来应对过度的脂质合成，这提出了一个可能的新治疗靶点和预后标志物。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。