克服衰老以工程化可扩展通用T细胞疗法 [RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE339292

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

过继性细胞疗法已为部分癌症患者带来变革性疗效。自体细胞疗法面临诸多挑战，因此需要建立异体策略。然而，细胞衰老限制了淋巴细胞的增殖和功能，制约了我们生产可规模化异体解决方案以提高患者可及性的能力。T细胞或NK细胞的体外激活会加速这一过程，削弱其扩增能力和效应功能。为解决这一问题，我们整合了T细胞淋巴增殖性疾病、白血病T细胞系、全基因组CRISPR筛选和转基因富集筛选的见解，开发了一种靶向复制性衰老相关基因的基因编辑策略。将该编辑策略应用于健康供者CD8+ T细胞后，可实现百亿亿倍（quintillion-fold）的体外扩增，同时保留效应功能和淋巴细胞的基本特性。进一步工程化改造，引入CAR转基因和组织相容性编辑，使单个供者能够生产数千剂“通用效应细胞”（Universal Effector Cell，UEC）。UEC提供了一种可规模化、即用型的细胞治疗平台，能够提供强效、功能性治疗产品并改善患者可及性。

我们的结果强调了精确调节淋巴细胞中的细胞周期调控机制如何实现巨大的可扩展性，同时不影响正常的免疫效应功能或核心淋巴细胞特性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。