GSE338335：一种具有神经内分泌和上皮分化的新型松果体肿瘤（PINNED）的鉴定与表征

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE338335

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数据说明

松果体区肿瘤是罕见的肿瘤，可发生于任何年龄，在成人中占所有中枢神经系统（CNS）肿瘤的不到1%，但在儿童中更为常见。在此，我们描述了一种此前未被认识的松果体来源肿瘤类型，其特征是独特且一致的DNA甲基化谱，与任何已知的CNS肿瘤类别均不匹配，且与目前所有已确认的松果体肿瘤实体均不同。所呈现的队列（n = 27）显示性别分布均衡，患者平均年龄为35岁（范围：7–75岁）。组织病理学分析显示为细胞密集的恶性肿瘤，表现出不同程度的坏死、核分裂活性、乳头状结构、菊形团、上皮样细胞学或印戒样细胞。肿瘤一致表达细胞角蛋白18、突触素、嗜铬粒蛋白A和OTX2，而CRX表达缺失。16例肿瘤中有4例（25%）显示ATRX突变和/或免疫组织化学所揭示的蛋白表达缺失。单核RNA测序证实了其与其他松果体肿瘤的分子独特性，但显示其与松果体区乳头状肿瘤（PTPR）最为相似。

将转录组数据投射到发育中小鼠松果体的细胞轨迹上，提示松果体细胞祖细胞是其细胞起源。综上所述，我们的发现定义了一种新型松果体区肿瘤，我们暂将其命名为“具有神经内分泌和上皮分化的松果体肿瘤”（PINNED）。识别这一肿瘤类型对于松果体区肿瘤的准确诊断似乎很重要，并可能对未来的肿瘤分类和治疗策略产生影响。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。