PM2.5对野生型与恶性转化小鼠乳腺上皮细胞球体RNA-seq比较分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE337004

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细颗粒物（PM2.5）暴露与癌症的发生和发展有关，但其在三维环境中对正常与转化上皮细胞的影响仍不完全清楚。在本研究中，我们对野生型EpH4小鼠乳腺上皮细胞及其恶性转化对应细胞EpH4-AS的球体培养物进行了批量RNA测序。两种细胞类型均在未处理条件和PM2.5暴露后进行了分析。该数据集使得能够在3D培养系统中比较分析恶性转化细胞与健康野生型细胞在PM2.5暴露后的差异转录组反应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。