印度患者口腔鳞状细胞癌RNA测序综合转录组图谱
该数据集为印度患者口腔鳞状细胞癌(OSCC)的RNA测序转录组数据,包含原发OSCC组织与配对癌旁非肿瘤组织的表达谱。通过差异基因表达和通路富集分析,发现MAPK信号通路显著失调,EGFR和HRAS为关键改变基因

基本信息
资源简介
印度患者口腔鳞状细胞癌RNA测序综合转录组图谱
Comprehensive Transcriptomic Profiling of Oral Squamous Cell Carcinoma in Indian Patients by RNA Sequencing
该数据集为印度患者口腔鳞状细胞癌(OSCC)的RNA测序转录组数据,包含原发OSCC组织与配对癌旁非肿瘤组织的表达谱。通过差异基因表达和通路富集分析,发现MAPK信号通路显著失调,EGFR和HRAS为关键改变基因。数据可用于识别OSCC的分子生物标志物和治疗靶点,并支持口腔癌发生分子机制的进一步研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jun 29 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):口腔鳞状细胞癌(OSCC)是口腔最常见的恶性肿瘤,其特征是广泛的分子改变,这些改变促进肿瘤进展和治疗耐药。为研究OSCC相关的转录组变化,对原发OSCC组织和配对的癌旁非肿瘤组织进行了RNA测序。差异基因表达和通路富集分析发现MAPK信号通路显著失调,EGFR和HRAS成为关键改变基因。该数据集为识别印度患者OSCC的分子生物标志物和治疗靶点提供了转录组资源,并支持对口腔癌发生分子机制的进一步研究。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE336948
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 27 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE336948
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
口腔鳞状细胞癌(OSCC)是口腔最常见的恶性肿瘤,其特征是广泛的分子改变,这些改变促进了肿瘤进展和治疗耐药。为了研究与OSCC相关的转录组变化,对原发性OSCC组织和配对的癌旁非肿瘤组织进行了RNA测序。差异基因表达和通路富集分析发现MAPK信号通路存在显著失调,其中EGFR和HRAS是关键改变基因。该数据集为识别印度患者OSCC的分子生物标志物和治疗靶点提供了转录组资源,并支持进一步研究口腔癌发生的分子机制。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




