HIV-1 劫持 HGF/c-MET 信号促进原代 CD4⁺ T 细胞病毒进入与复制

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 HIV-1 劫持 HGF/c-MET 信号促进原代 CD4⁺ T 细胞病毒进入与复制,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为人类(9606),平台为 GPL16791,仅含 1 个文件 GSE335060_series_matrix.txt.gz

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时间序列分类GPL167919606
GSE335060: HIV-1 Hijacks HGF/c-MET Signaling to Promote Viral Entry and Replication in Primary CD4⁺ T Cells

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

HIV-1 劫持 HGF/c-MET 信号促进原代 CD4⁺ T 细胞病毒进入与复制

HIV-1 Hijacks HGF/c-MET Signaling to Promote Viral Entry and Replication in Primary CD4⁺ T Cells

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 HIV-1 劫持 HGF/c-MET 信号促进原代 CD4⁺ T 细胞病毒进入与复制,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为人类(9606),平台为 GPL16791,仅含 1 个文件 GSE335060_series_matrix.txt.gz。研究关注 c-MET 在 HIV-1 感染中的作用,涉及 CD4 受体与 CXCR4 共受体表达变化及病毒进入、复制过程,可用于探索 HIV-1 感染相关宿主信号机制与潜在治疗靶点(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 11 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):细胞间充质-上皮转化因子(c-MET)是一种受体酪氨酸激酶,与肝细胞生长因子(HGF)结合以驱动癌症转移,因此成为关键的治疗靶点。许多细胞蛋白参与 HIV-1 复制和先天免疫。然而,c-MET 在 HIV-1 感染中的作用尚不清楚。在此,我们证明 HIV-1 感染会增加 CD4+ T 细胞中 c-MET mRNA 和磷酸化 MET 蛋白(p-MET)水平,而抑制 HIV-1 复制会降低 p-MET 水平。在 MT4 细胞中敲除(KO)c-MET 会降低 HIV-1 Gag mRNA 和蛋白水平以及释放到上清液中的病毒衣壳,表明 c-MET 支持 HIV-1 复制。值得注意的是,c-MET KO 细胞中 CD4 受体和 CXCR4 共受体的细胞表面表达也下降,提示 c-MET 通过调节病毒进入来促进 HIV-1 复制。Int

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL16791、9606。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335060

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 01 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

细胞间充质-上皮转化因子(c-MET)是一种受体酪氨酸激酶,与肝细胞生长因子(HGF)结合,驱动癌症转移,因此成为一个关键的治疗靶点。许多细胞蛋白参与HIV-1复制和先天免疫。然而,c-MET在HIV-1感染中的作用尚不清楚。在此,我们证明HIV-1感染增加了CD4+ T细胞中c-MET mRNA和磷酸化MET蛋白(p-MET)的水平,而抑制HIV-1复制则降低了p-MET水平。在MT4细胞中敲除(KO)c-MET减少了HIV-1 Gag mRNA和蛋白质水平以及病毒衣壳释放到上清液中,表明c-MET支持HIV-1复制。值得注意的是,c-MET KO细胞中CD4受体和CXCR4共受体的细胞表面表达也减少,提示c-MET通过调节病毒进入来促进HIV-1复制。有趣的是,MT4细胞中c-MET KO减少了p38丝裂原活化蛋白激酶、NF-kB激活以及信号转导和转录激活因子(STAT)1/3的磷酸化,从而在HIV-1感染期间调控多种信号通路。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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