KRAS突变重编程RNA m6A修饰驱动结直肠癌CD73依赖免疫逃逸[RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE333904

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

约40%的结直肠癌（CRC）中存在KRAS突变，其与免疫抑制性肿瘤微环境密切相关，该微环境以免疫浸润受限和对免疫治疗反应不佳为特征。在此，我们证明KRAS突变重塑m6A表观转录组以促进免疫逃逸。对同基因CRC细胞进行甲基化RNA免疫沉淀测序显示，KRAS突变细胞中CD73 mRNA上的N6-甲基腺苷（m6A）沉积增加，通过促进与IGF2BP3的相互作用增强转录本的稳定性。这种m6A修饰由TEAD4依赖的METTL3甲基转移酶复合物招募所驱动，从而将TEAD4鉴定为m6A沉积的空间调控因子。在功能上，在KRAS突变同基因肿瘤中敲低METTL3可抑制肿瘤生长，并以CD73依赖的方式增加CD8⁺ T细胞和自然杀伤（NK）细胞浸润，从而恢复抗肿瘤免疫。此外，抑制METTL3与抗PD-1治疗及CD73抑制剂协同作用，可减轻肿瘤负荷。

总之，这些发现表明KRAS驱动的m6A重塑是结直肠癌免疫抑制的关键机制，并凸显METTL3作为有前景的治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。