SETD8介导YAP K76单甲基化促进K48连接多泛素化降解抑制结直肠癌

该数据集来自NCBI GEO,包含1个高通量测序表达谱文件,研究SETD8对结直肠癌的抑癌作用及其机制。SETD8与YAP物理互作并催化YAP第76位赖氨酸单甲基化(K76me),该修饰增强YAP的K48连接多泛素化与降解,从而抑制YAP蛋白表达

geo
浏览 2
基因组预测GPL246769606
GSE332607: SETD8-mediated mono-methylation of YAP at K76 promotes K48-linked polyubiquitination and degradation to suppress colorectal cancer​​

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

SETD8介导YAP K76单甲基化促进K48连接多泛素化降解抑制结直肠癌

SETD8-mediated mono-methylation of YAP at K76 promotes K48-linked polyubiquitination and degradation to suppress colorectal cancer​​

该数据集来自NCBI GEO,包含1个高通量测序表达谱文件,研究SETD8对结直肠癌的抑癌作用及其机制。SETD8与YAP物理互作并催化YAP第76位赖氨酸单甲基化(K76me),该修饰增强YAP的K48连接多泛素化与降解,从而抑制YAP蛋白表达。数据可用于分析SETD8-YAP调控轴在结直肠癌中的表达变化及相关通路研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 20 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Yes相关蛋白(YAP)是Hippo通路的关键效应分子,在结直肠癌(CRC)中作用明确。然而,YAP位点特异性翻译后修饰(PTM),尤其是甲基化的功能相关性,仍研究不足。含SET结构域蛋白8(SETD8)是组蛋白4赖氨酸20(H4K20)唯一的单甲基转移酶,参与多种癌症,但其在CRC中的生物学功能及潜在机制尚不清楚。尽管SETD8主要以组蛋白甲基化活性著称,其修饰非组蛋白(如YAP)的能力仍很大程度上未被探索。本研究旨在证明SETD8通过抑制YAP蛋白表达对CRC发挥抑癌作用。机制上,SETD8与YAP物理互作,催化赖氨酸76位点单甲基化(K76me)。该修饰增强

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE332607

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 29 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE332607

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Yes相关蛋白(YAP)是Hippo通路的关键效应分子,在结直肠癌(CRC)中已确立重要作用。然而,YAP位点特异性翻译后修饰(PTMs),尤其是甲基化的功能相关性,仍研究不足。含SET结构域蛋白8(SETD8)是组蛋白4赖氨酸20(H4K20)唯一单甲基转移酶,参与多种癌症,但其在CRC中的生物学功能及潜在机制尚不明确。SETD8主要以组蛋白甲基化活性著称,但其修饰非组蛋白(如YAP)的能力仍 largely 未被探索。本研究旨在证明SETD8通过抑制YAP蛋白表达对CRC发挥抑瘤作用。机制上,SETD8与YAP物理互作,催化赖氨酸76位点单甲基化(K76me)。该修饰增强YAP与E3泛素连接酶环指蛋白31(RNF31)的相互作用,促进YAP K48连接多泛素化及随后的蛋白酶体降解。

临床上,SETD8高表达(包括YAP K76me水平升高)的结直肠癌患者表现出较好的病理分级和改善的预后。综上所述,我们的研究结果确定了一条限制结直肠癌进展的新型SETD8-YAP K76me调控轴,提示靶向该调控轴可能是一种有前景的治疗策略。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案