SETD8介导YAP K76单甲基化促进K48连接多泛素化降解抑制结直肠癌
该数据集来自NCBI GEO,包含1个高通量测序表达谱文件,研究SETD8对结直肠癌的抑癌作用及其机制。SETD8与YAP物理互作并催化YAP第76位赖氨酸单甲基化(K76me),该修饰增强YAP的K48连接多泛素化与降解,从而抑制YAP蛋白表达

基本信息
资源简介
SETD8介导YAP K76单甲基化促进K48连接多泛素化降解抑制结直肠癌
SETD8-mediated mono-methylation of YAP at K76 promotes K48-linked polyubiquitination and degradation to suppress colorectal cancer
该数据集来自NCBI GEO,包含1个高通量测序表达谱文件,研究SETD8对结直肠癌的抑癌作用及其机制。SETD8与YAP物理互作并催化YAP第76位赖氨酸单甲基化(K76me),该修饰增强YAP的K48连接多泛素化与降解,从而抑制YAP蛋白表达。数据可用于分析SETD8-YAP调控轴在结直肠癌中的表达变化及相关通路研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 20 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):Yes相关蛋白(YAP)是Hippo通路的关键效应分子,在结直肠癌(CRC)中作用明确。然而,YAP位点特异性翻译后修饰(PTM),尤其是甲基化的功能相关性,仍研究不足。含SET结构域蛋白8(SETD8)是组蛋白4赖氨酸20(H4K20)唯一的单甲基转移酶,参与多种癌症,但其在CRC中的生物学功能及潜在机制尚不清楚。尽管SETD8主要以组蛋白甲基化活性著称,其修饰非组蛋白(如YAP)的能力仍很大程度上未被探索。本研究旨在证明SETD8通过抑制YAP蛋白表达对CRC发挥抑癌作用。机制上,SETD8与YAP物理互作,催化赖氨酸76位点单甲基化(K76me)。该修饰增强
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE332607
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· 源站最后修改于 Jul 29 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
Yes相关蛋白(YAP)是Hippo通路的关键效应分子,在结直肠癌(CRC)中已确立重要作用。然而,YAP位点特异性翻译后修饰(PTMs),尤其是甲基化的功能相关性,仍研究不足。含SET结构域蛋白8(SETD8)是组蛋白4赖氨酸20(H4K20)唯一单甲基转移酶,参与多种癌症,但其在CRC中的生物学功能及潜在机制尚不明确。SETD8主要以组蛋白甲基化活性著称,但其修饰非组蛋白(如YAP)的能力仍 largely 未被探索。本研究旨在证明SETD8通过抑制YAP蛋白表达对CRC发挥抑瘤作用。机制上,SETD8与YAP物理互作,催化赖氨酸76位点单甲基化(K76me)。该修饰增强YAP与E3泛素连接酶环指蛋白31(RNF31)的相互作用,促进YAP K48连接多泛素化及随后的蛋白酶体降解。
临床上,SETD8高表达(包括YAP K76me水平升高)的结直肠癌患者表现出较好的病理分级和改善的预后。综上所述,我们的研究结果确定了一条限制结直肠癌进展的新型SETD8-YAP K76me调控轴,提示靶向该调控轴可能是一种有前景的治疗策略。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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