患者肿瘤来源抗体增强癌症免疫检查点阻断应答数据集
该数据集来自 NCBI GEO(GSE331322),聚焦于患者肿瘤来源抗体对免疫检查点阻断应答的增强作用。研究对接受 α-PD-1 联合 α-CTLA-4 治疗的应答者与非应答者的肿瘤浸润 B 细胞(TIL-Bs)及三级淋巴结构(TLS)进行图谱分析,以识别免疫特征

基本信息
资源简介
患者肿瘤来源抗体增强癌症免疫检查点阻断应答数据集
Antibodies derived from patient tumors augment response to immune checkpoint blockade in cancer
该数据集来自 NCBI GEO(GSE331322),聚焦于患者肿瘤来源抗体对免疫检查点阻断应答的增强作用。研究对接受 α-PD-1 联合 α-CTLA-4 治疗的应答者与非应答者的肿瘤浸润 B 细胞(TIL-Bs)及三级淋巴结构(TLS)进行图谱分析,以识别免疫特征。数据包含 1 个文件(GSE331322_series_matrix.txt.gz),可用于探索与免疫治疗应答相关的 B 细胞和 TLS 免疫签名(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 18 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):B 细胞与免疫治疗的有利应答相关,但其潜在机制仍不清楚。在此,我们对接受 α-PD-1 + α-CTLA-4 治疗的应答者(R)和非应答者(NR)的肿瘤浸润 B 细胞(TIL-Bs)和三级淋巴结构(TLS)进行了分析,以识别免疫特征。应答者的 TLS 表现出炎症基因上调,以及细胞毒性免疫细胞水平升高。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Other、GPL24676、9606。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE331322
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 20 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE331322
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
B细胞与免疫治疗的有利应答相关,但其潜在机制仍不清楚。在此,我们对接受α-PD-1 + α-CTLA-4治疗的应答者(R)和非应答者(NR)的肿瘤浸润B细胞(TIL-Bs)和三级淋巴结构(TLS)进行了分析,以识别免疫特征。应答者的TLS表现出炎症基因上调以及细胞毒性免疫细胞水平升高。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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